原著
肺腺癌患者血清microRNAプロファイルのdeep sequencingによる解析
2020 年 51 巻 1 号 p. 3-10
詳細
2020 年 51 巻 1 号 p. 3-10
がん患者血中microRNA（miRNA）は，診断や予後予測のための低侵襲性マーカーとして期待されてきた。しかし，これまで肺癌の再発マーカーとして確立したmiRNAはない。近年，各種組織や細胞のmiRNA deep sequencing解析により，miRNAデータベースmiRBaseに登録されているmiRNA（miRBase型）と末端の長さが僅かに異なるisoform（isomiR）が多数存在することが分かってきた。本研究において，肺腺癌の再発マーカーの検索を目的とし，患者1例について，RNA deep sequencingにより外科的切除前，切除後，および再発5ヶ月前の血清miRNAプロファイルを比較した。患者血清中には約550種の成熟miRNAが検出され，isomiRの総read数はmiRBase型miRNAの総read数を上回った。また，13種類の新規miRNA候補を同定した。既知のmiRNAの解析において，血清サンプル間でread数が顕著に異なるisomiR 3種，miRBase型miRNA1種を選出した。このうちのisomiR2種，および新規miRNA候補のうちの1種は，再発5ヶ月前のread数が切除7週後の約7.0〜14.9倍であった。これら3種は，肺腺癌患者血清において，再発前に顕著に上昇する可能性が考えられる。
