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バイオインフォマティクス推進センター事業(BIRD) 第5回研究開発成果報告会  知識発見への挑戦 〜未来へつながるバイオインフォマティクス〜 要旨集 


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ListMark生命システム解明への挑戦

予測技術を用いた生命システムの同定手法の開発
4-8

石井 信
[抄録] [PDF (1971K)


メタゲノムオーソログ遺伝子統合解析システムの開発
9-14

黒川 顕
[抄録] [PDF (2450K)


転写制御領域の構築原理解明
15-19

中井 謙太
[抄録] [PDF (928K)


ListMarkタンパク質相互作用予測

タンパク質化合物相互作用の網羅的予測手法とデータベースの開発
20-24

榊原 康文
[抄録] [PDF (2499K)


高精度タンパク質間相互作用予測システムの開発
25-31

清水 謙多郎
[抄録] [PDF (2346K)


ListMarkポスター発表

ListMark生命情報データベースの高度化・標準化

ListMark第II期研究開発課題

ホヤプロテイン統合データベースの構築
CIPROにおけるタンパク質間相互作用可視化プログラムの開発
32

上野 恵介, 峯田 克彦, 遠藤 俊徳
[抄録] [PDF (273K)


ゲノムと環境の統合解析による生命システムの機能解読(KEGG)
KEGG MEDICUS: 疾患・医薬品の分子ネットワーク情報リソース
32

金久 實, 田辺 麻央, 平川 美夏, 渡辺 真理, 緒方 麻紀子, 木内 ふみ
[抄録] [PDF (273K)


バイオ基幹情報資源の高準化と共用化
バイオ情報資源の高準化と共用化:Web API for Biology(WABI)の広がり
33

菅原 秀明, 權 娟大, 宮崎 智, 川本 祥子, 神沼 英理, 中村 保一, 舘野 義男, 五條堀 孝, 猿橋 智, 児玉 悠一
[抄録] [PDF (277K)


オントロジーによるパスウェイの高度化および国際標準化
(INOHパスウェイデータベース)
INOHパスウェイデータベース
33

酒井 智子, 酒井 紀子, 中村 浩実, 福田 賢一郎, 高木 利久
[抄録] [PDF (277K)


蛋白質構造データバンクの国際的な構築と高度化(PDBj)
PDBj Mine: 日本蛋白質構造データバンクの新しい検索システム
34

金城 玲, 中村 春木, 山下 鈴子
[抄録] [PDF (256K)


メタボロームMSスペクトル統合データベースの開発
(Metabolome-Mass Spectral Database)
マススペクトルデータベースMassBankの新機能
―データベース管理環境、Web API、ピーク同定情報の検索―
34

蓬莱 尚幸, 二瓶 義人, 池田 奨, 尾嶌 雄也, 西岡 孝明
[抄録] [PDF (256K)


マルチモーダル統合バイオDB(Multimodal BIODB)
UTGB Toolkitでゲノムブラウザを作る
35

斉藤 太郎, 吉村 淳, バドルル・アーサン  , 佐々木 惇, レジナルド・クロス  , 森下 真一
[抄録] [PDF (274K)


ListMark創造的な生物・情報知識融合型の研究開発

ListMark平成19年度採択新規研究開発課題

酵素反応分類に基づく酵素反応予測システムの開発
酵素活性部位探索に対する機械学習の適用
36

長野 希美, 加藤 毅
[抄録] [PDF (273K)


進化型計算と自己組織化による適応的画像分類法の開発
クラスタリングと組み合わせ最適化を用いた生体画像の適応的自動分類法の開発
36

馳澤 盛一郎, 朽名 夏麿, 桧垣 匠, 松永 幸大, 藤井 博史, 山口 雅之
[抄録] [PDF (273K)


生命科学上の非構造化データの統合マイニング
生命科学上の非構造化データの統合マイニング
37

馬見塚 拓, 志賀 元紀, 茅野 光範, 瀧川 一学, 津田 宏治
[抄録] [PDF (275K)


ダイナミクスを考慮した膜蛋白質の構造モデリング法の開発
膜タンパク質のダイナミクスとタンパク質―脂質間相互作用の解析
37

森田 瑞樹, Mohan Krishna, 森 貴治, Ahmad Shandar, 森 博幸, 岡本 祐幸, 杉田 有治, 水口 賢司
[抄録] [PDF (275K)


ListMark平成20年度採択継続研究開発課題

大規模比較ゲノムワークベンチの実践的応用に向けた研究開発
比較ゲノムワークベンチRECOGの開発と応用
38

内山 郁夫, 河合 幹彦
[抄録] [PDF (266K)


タンパク質の構造・機能・相互作用予測システムの開発と展開
会合状態とドメイン構成に着目した同一スーパーファミリーにおける加水分解酵素 ―転移酵素の機能転移メカニズムの解析
38

小池 亮太郎, 木寺 詔紀, 太田 元規
[抄録] [PDF (266K)


ヒト胚の形態発生に関する三次元データベース
ヒト胎児発生の画像データベースと3次元CGコンテンツ
39

山田 重人, 巨瀬 勝美, 松田 善正, 美濃 導彦, 角所 考, 元木 環, 嶺倉 豊, 水田 忍, 松田 哲也, 上部 千賀子, 塩田 浩平
[抄録] [PDF (277K)


実践による超分子ネットワークモデリングシステムの開発
超分子ネットワークモデリングシステムによる積み木生物学の実践
39

白井 剛, 斉藤 美保子, 吉永 淳, 大山 拓次, 真柳 浩太, 石野 良純
[抄録] [PDF (277K)



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