Chem-Bio Informatics Journal
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原核ゲノムにおけるタンデムリピート検索のためのカラーコーディング法の評価
水田 智史棟方 光アブリミティ エイメイティ大澤 研二清水 俊夫
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2004 年 4 巻 4 号 p. 133-141

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抄録

人間の視覚による検知に基礎をおくカラーコーディング(CC)法を用い、3人の検索者によって Yersinia pestis, Deinococcus radiodurans, そして Haemophilus influenzae ゲノムから多くのタンデムリピートを検出し、検出されたタンデムリピートを比較することによってタンデムリピートを検索する上での検索者の個人差を調査した。我々はまた、CC法とタンデムリピートのアルゴリズミックな検索手法の一つである Tandem Repeats Finder (TRF) とを検索能力の上で比較し、CC法はTRFに比べてより長くかつより一致度の低いタンデムリピートを検出することができるということを示した。

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2004 Chem-Bio Informatics Society
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