ニホングリで開発された7対のSSRプライマーを用いて，朝鮮半島由来のクリ品種のSSR遺伝子型を解析し，チュウゴクグリ17品種，ニホングリ32品種，およびニホングリとチュウゴクグリの種間雑種1品種の遺伝子型と比較した．用いたニホングリのプライマーのうち，KT006a座のみチュウゴクグリ3品種において検出されなかったが，それ以外の遺伝子座では，用いた全品種のSSR対立遺伝子型を決定できた．その結果，チュウゴクグリにおいて合計26種類，ニホングリにおいて合計37種類の種特異的な対立遺伝子が得られた．一方，朝鮮半島由来のクリ7品種においても全7遺伝子座の遺伝子型を明らかにすることに成功し，座あたり2～9種類の対立遺伝子（平均5.14種類）が検出された．種特異的な対立遺伝子に着目して両者を比較した結果，‘兎山9’，‘兎山13’，‘兎山60’，‘仁興王栗’および‘韓6’はニホングリ，‘咸従3号’はチュウゴクグリ，そして‘大城’はチュウゴクグリとニホングリの種間雑種品種であると推察された．一方，‘韓6’と‘丹沢’および‘大城’と‘利平ぐり’の間で，それぞれ7遺伝子座のSSR対立遺伝子型がすべて一致したことから，これらはそれぞれ異名同一品種の関係にあるか，枝変わり品種とその原品種の関係にある可能性が示唆された．
