遺伝子ネットワークモデルにおけるデータ同化と大規模並列粒子フィルタによる実装

抄録

遺伝子ネットワークモデルにおけるデータ同化手法の枠組について概観し，その中の一実装である大規模並列粒子フィルタ手法を，概日周期モデルに対して適用した結果について示す．概日周期モデルは，ハイブリッドペトリネットにより表現された，常微分方程式ベースのシミュレーションモデルを用いている．今回，粒子フィルタベースのデータ同化手法について，新たな並列化実装を行い，理論面ならびに実性能面での評価を行った．評価の結果，高並列計算の条件下でも，新実装が有効であることが示唆された．