イネ黒条萎縮ウイルス(RBSDV)とmaize rough dwarf virus (MRDV)ゲノムを用いたハイブリダイゼーションにより,両ウイルスのゲノムセグメントの関係を明らかにした。RBSDVとMRDVの塩基配列の比較からRBSDV S7とMRDV S6, RBSDV S8とMRDV S9が高い相同性を持つことが報告されている。しかし,RBSDV S7, 8由来のcDNAをプローブとしてMRDVゲノムとのノーザンハイブリダイゼーションを行うと,MRDVの移動度が遅い方からそれぞれ7, 8番目のセグメントにシグナルが検出された。このことから,RBSDVとMRDVのセグメントの対応関係がずれているのではなく,MRDVのセグメント番号の付け方(Marzachí et al., Virology, 1991)が間違っていることが分かった。さらに,両ウイルスの塩基配列の相同性を解析するため,S3を除く各RBSDVセグメント由来のcDNAをプローブに用いてMRDVゲノムとハイブリダイゼーションを行った。その結果,RBSDV S1, 4, 5, 6由来のcDNAは,他のRBSDVセグメント由来のcDNAと比較してMRDVゲノムと相同性が低かった。またRBSDV S5, 6由来のcDNAは,よりMRDVと相同性が低く,RBSDVとMRDVを判別できることを示唆した。
