無細胞合成ペプチドを利用したタンパク質絶対定量

抄録

近年，高い感度と定量精度でタンパク質を絶対定量する方法として，質量分析によるターゲットプロテオミクスが発展してきた．しかしこの方法は，内部標準となる濃度決定した安定同位体標識ペプチドを必要とし，それが得難いことが一つのボトルネックとなっていた．筆者らは無細胞タンパク質合成系のPURE systemを用い，安定同位体標識ペプチドを，簡便かつ多種少量で合成し，絶対定量に利用する方法（MS-based Quantification By isotope-labeled Cell-free products，MS-QBiC）を開発した．MS-QBiCにより多数の内部標準を得られることで，多数のタンパク質の解析が可能になることはもちろん，1タンパク質あたり複数のターゲット配列候補から高感度な配列を選択できる．さらに超高感度分析のための2次元SRM解析における解析ペプチド数の増大に対応が可能である．