近年，河川や沿岸域等の水環境において，ふん便に由来する病原性微生物によって汚染されることがたびたび問題となっており，ヒトへの感染・発症リスクはそれほど低くないといわれている．本研究では，病原性微生物の存否の指標となるふん便指標細菌の汚染状況を把握するために，大分県内の河川と沿岸域を対象に，ふん便性大腸菌群（FC）と腸球菌（ENT）のモニタリング調査を実施した．調査期間は2012年6月～12月とし，毎月一回の調査を実施した．各調査地点において，FC，およびENTはそれぞれBDL（Below detection limit，検出下限値以下）～1.0×104CFU/100 mL，およびBDL～3.6×103CFU/100 mLの範囲で検出された．いずれのふん便性細菌も調査地点，および調査日によって大きく変動した．沿岸域の調査地点は河川と比較して細菌数は低かった．
