生物物理

43 巻, supplement 号

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Rasの構造多型性の1分子イメージング

新井由之, 和沢鉄一, 横田浩章, 岩根敦子, 石井由晴, 片岡徹, 柳田敏雄

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S49-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S49_3

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大腸菌外膜チャネルタンパク質、マルトポリンの計算機シミュレーション

関和彦, 末永敦, 成見哲, 秦地真弘, C. Danelon, M. Winterhaulter, 安藤格士, 目黒俊幸, 山 ...

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S49-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S49_4

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静電ポテンシャルと分子表面形状による蛋白質のDNA結合能および結合部位の予測

土屋裕子, 木下賢吾, 中村春木

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S50-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S50_1

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分子動力学法によるMutTの8-oxo-dGMP認識機構解明

樋口真理子, 石田恒, 北尾彰朗, 山縣ゆり子, 郷信広

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S50-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S50_2

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バルナーゼのアンフォールディング過程におけるモジュール構成の保存

篠田和紀, 高橋健一, 郷通子

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S50-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S50_3

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抗体の親和性成熟に関する量子化学的研究

大野一樹, 井上義夫, 櫻井実

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S50-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S50_4

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単体・複合体の立体構造変化の解析による分子認識機構解析

加藤雅樹, 輪湖博, 木下賢吾, 木寺詔紀

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S51-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S51_1

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蛋白質・リガンド相互作用データベース、ProLINT、の開発とQSAR解析

北島浩司, Shandar Ahmad, 久保寺英夫, 砂田真二, 皿井明倫

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S51-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S51_2

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Superfamilyを超えた蛋白質構造の進化的類縁関係 : Fold-based superfamily

松田敬子, 川端猛, 木下賢吾, 西岡孝明, 郷信広

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S51-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S51_3

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タンパク質のde novo立体構造予測 : ポテンシャル関数の最適化

藤墳佳見, 千見寺浄慈, 高田彰二

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S51-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S51_4

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タンパク質立体構造の高精度モデリングに向けて : 力場の改善

金城玲, 長島剛宏, 三井崇志, 西川建

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S52-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S52_1

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単一アミノ酸ポテンシャル力場(SAAP力場)の開発と性能評価

岩岡道夫, 吉田大介

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S52-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S52_2

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Ab initio MO法によるペプチド鎖の分子力場の解析

松本博希, 関安孝, 曽田邦嗣

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S52-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S52_3

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仮想的な構造データベースを用いた経験的ポテンシャルの検証

弓削洋平, 中村寛則, 高野光則, 陶山明

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S52-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S52_4

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遺伝的アルゴリズムで最適化した力場パラメータによる、ペプチド鎖のモンテカルロシミュレーション

目黒俊幸, 安藤格士, 山登一郎

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S53-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S53_1

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力場及びimplicit溶媒によるポテンシャルエネルギー曲面とダイナミクスの変化

小山洋平, 高野光則, 友田修司, 陶山明

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S53-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S53_2

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蛋白質の構造変化を考慮したリガンド-蛋白質ドッキングに向けた新手法の開発

巽理恵, 福西快文, 中村春木

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S53-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S53_3

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Ras蛋白質における動的構造多形性とエネルギーランドスケープ

大口真次, 寺田智樹, 笹井理生

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S53-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S53_4

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カメレオン配列の自由エネルギー地形

肥後順一, 池田和由

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S54-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S54_1

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分子動力学法を用いた蛋白質水和構造における水素結合パターンの解析

横溝剛, 山崎俊正, 神藤平三郎, 中迫雅由, 肥後順一

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S54-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S54_2

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分子動力学シミュレーションによるリゾチームの体積揺らぎ動力学

森一樹, 関安孝, 曽田邦嗣

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S54-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S54_3

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分子動力学計算を用いた活性部位の動的性質の解明

徳久淳師, 中川洋, 上久保裕生, 城地保昌, 北尾彰朗, 片岡幹雄

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S54-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S54_4

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非干渉性中性子散乱による蛋白質動力学の時間スケール依存性

中川洋, 上久保裕生, 筑紫格, 金谷利治, J.C. Smith, 片岡幹雄

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S55-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S55_1

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大規模構造変化におけるモード結合

伊藤一仁, 笹井理生

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S55-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S55_2

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FRETによるGroEL内部での基質タンパク質の運動解析

上野太郎, 田口英樹, 多田隈尚史, 吉田賢右, 船津高志

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S55-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S55_3

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大腸菌ClpBの蛋白質修復機能における立体構造の揺らぎの役割

谷泰史, 田中直毅

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S55-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S55_4

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質量分析法によるDHFRの特異的局所構造揺らぎの解析

山本竜也, 泉俊輔, 月向邦彦

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S56-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S56_1

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フラグメントアセンブリ法におけるフラグメント長とエネルギーランドスケープ

千見寺浄慈, 藤墳佳見, 高田彰二

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S56-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S56_2

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β-sheetを含むタンパク質の構造予測に向けての粗視化モデル構築

佐々木尚, 笹井理生

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S56-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S56_3

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環境によって誘起される蛋白質の二次構造 : レプリカ交換法によるサンプリング

亀田倫史, 高田彰二

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S56-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S56_4

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Inter-residue Interactions in Protein Structures : Applications to Protein Folding and Stability

Michael Gromiha, Samuel Selvaraj

原稿種別: Article
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S57-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S57_1

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Janus-type Goモデルを用いたフォールディング過程における中間構造蓄積量決定因子の探求

中村寛則, 高野光則

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S57-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S57_2

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タンパク質フォールディング過程における天然接触ペアと非天然接触ペアの出現頻度と役割

安部晴男, 輪湖博

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S57-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S57_3

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ブラウン動力学法によるタンパク質折り畳みの自由エネルギー地形解析

安藤格士, 目黒俊幸, 山登一郎

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S57-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S57_4

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タンパク質フォールディングにおけるシャペロニンの閉じ込め効果と強制アンフォールディング : 分子動力学シミュレーション

高城史子, 高田彰二

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S58-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S58_1

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タンパク質の折りたたみおける混雑効果

根木滋, 徳力伸彦, 金城正孝, 卜部格, 四方哲也

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S58-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S58_2

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2SS変異体のHD交換反応からリゾチームの折りたたみ反応初期過程を考察する

坂本恵子, 山崎向太, 東やすよ, 野田康夫, 橘秀樹, 瀬川新一

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S58-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S58_3

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ヤギα-ラクトアルブミンα-ドメイン変異体の安定性とフォールディング反応

佐伯喜美子, 新井宗仁, 桑島邦博

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S58-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S58_4

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シトクロムcのサブミリ秒折れたたみ中間体の多孔性ゲルによる固定化

柴山修哉, 西郷敏

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S59-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S59_1

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シトクロムcの折れ畳み初期に形成する疎水性クラスターの性質

屋根晃, 高橋聡, 石森浩一郎, 森島績

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S59-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S59_2

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一本鎖モネリンの折り畳み機構に関する研究 : 二次構造形成過程と疎水性残基パッキング過程の追跡

木村哲就, 高橋聡, 今野卓, 石森浩一郎, 森島績

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S59-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S59_3

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Staphylococcal nucleaseにおける阻害剤誘導フォールディング反応

鬼塚正義, 上久保裕生, 中川洋, 山崎洋一, 今元泰, 片岡幹雄

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S59-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S59_4

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Early Folding Events of Staphylococcal Nuclease Monitored by Single-tryptophan Mutations and ANS Fluorescence

槇亙介, Hong Cheng, Dimitry A. Dolgikh, Heinrich Roder

原稿種別: Article
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S60-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S60_1

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アポミオグロビンの折れ畳み過程における主鎖の収縮と三次構造の構築

鵜澤尊規, 木村哲就, 高橋聡, 石森浩一郎, 森島績, 秋山修志, 藤澤哲郎

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S60-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S60_2

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網羅的1アミノ酸置換変異体を用いたジヒドロ葉酸還元酵素のフォールディング初期構造の解析

新井宗仁, 巌倉正寛

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S60-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S60_3

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プロリン変異体を用いたGFPリフォールディングの解析

開田奈津来, 座古保, 船津高志

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S60-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S60_4

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Leuのみを^<15>Nでラベルした超好熱菌由来蛋白質ピロリドンカルボキシペプチダーゼの変性と復元反応のNMRによる解析

飯村哲史, 八木宏昌, 小笠原京子, 阿久津秀雄, 野田康夫, 瀬川新一, 油谷克英

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S61-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S61_1

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緑色蛍光蛋白質変異体(Cycle3)の酸変性と巻き戻り

榎左和子, 佐伯喜美子, 桑島邦博

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S61-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S61_2

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コイルドコイルGCN4-p1'の折り畳み過程における揺らぎ領域の役割

木下雅仁, 木村哲就, 高橋聡, 石森浩一郎, 森島績

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S61-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S61_3

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MHC foldingに対するペプチド残基の限定的寄与

齊藤桂吾, 皿井明倫, 織田昌幸, 東隆親, 小園晴生

原稿種別: 本文
2003 年 43 巻 supplement 号 p. S61-
発行日: 2003/08/25
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.43.S61_4

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