土と微生物

土壌微生物のエコ・コレクションと進化・適応(共生・寄生微生物の進化と環境適応,シンポジウム)

服部勉

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 1-3
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_1

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Recent studies on the colony formation of soil bacteria opened the way to categorize soil bacteria into colony forming curve (CFC) groups of different growth rates. A bacterial culture collection comprising organisms from every CFC group is called an ecocollection (EC). One eco-collection of a paddy soil and two eco-collections of a grassland soil were comparatively studied. Sequencing 16S rDNA base sequences of strains from the three eco-collections revealed that strains of each CFC group were diverse and showed a trend to make clusters. In the case of the paddy soil eco-collection all strains belonged to Proteobacter alpha- and beta- subdivisions and Cytophaga/Flexibacter/Bacteroides division were oligotrophic. But, in the case of the grassland soil eco-collections, only the strains of Proteobacter alpha-subdivision were collectively oligotrophic. Based on these results the organization of the soil bacterial community and its evolutionary background were discussed.

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Rhizoctonia solaniにおける進化と適応(共生・寄生微生物の進化と環境適応,シンポジウム)

国永史朗

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 5-12
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_5

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R. solaniの進化の基本単位と種分化の機構をrDNA-ITSの塩基配列比較から考察した。本菌の菌糸融合群(AG)は「生物学的種」であるとみなされているが,ITS塩基配列の相同性比較から少なくともAG1, AG2-2, AG4の各subgroup (SG),およびAG3のpotatoとtobacco系統株は,進化の実質的な遺伝子流動集団であると考えられた。ITS塩基配列のデータから構築された分子系統樹より,同一AG内のSGは単系統群であり,それぞれ共通した祖先から分化した集団であることが示唆された。また系統樹から菌の生育温度反応の違いは生態的隔離を確立させ,分化の一つの要因となっていることが示唆された。本菌の各個体群の生活の場は,寄主選択性および発病や生存に必要な生育温度反応の違いなどの生物学的属性よってその条件を異にし,自然条件は個体群分化を生じさせる選択的機構の一つの場面を担っているものと推測された。bridging groupは互いに進化的に異なることが示され,菌糸融合の行動は必ずしも系統的な関係を反映しないことが示唆された。

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雪腐病菌における進化・適応(共生・寄生微生物の進化と環境適応,シンポジウム)

松本直幸

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 13-19
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_13

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積雪下は暗黒・低温・多湿で,このような特異的な環境下で雪腐病菌は独自の進化・適応を遂げた。雪腐病菌として重要な雪腐黒色小粒菌核病菌(Typhula ishikariensis)を中心に,その進化・適応について解説した。数十種が属すTyphula属において,そのほとんどは腐生菌である。そのなかで,低温生育性を発達させたものが病原菌になった。雪腐黒色小粒菌核病菌の活動範囲は積雪下に限定されており移動性が低いので,地域的な分化を生じやすい。各分類群の生態的特性とそれらの環境適応について概説した。最後に,個体群構造と菌核の特徴からみた地域個体群の環境適応戦略について説明した。

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菌根から地球環境を考える(共生・寄生微生物の進化と環境適応,シンポジウム)

堀越孝雄

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 21-24
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_21

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菌根のタイプとしては,現在のところ7種類が知られている。それらのうちで,樹枝状菌根はデボン紀の中期,外生菌根は白亜紀の中期頃出現したと考えられている。その後,菌根菌は宿主である植物と共進化をとげ,地球環境の形成と維持に重要な役割を果たしてきた。さまざまの陸上生態系において,菌根菌は植物の純一次生産の20から数十%を消費している。また,植物の光合成や同化産物の個体・群集レベルでの分配にも大きく関わっており,いまや菌根菌を抜きにしては,陸上生態系の物質循環を語れなくなってきている。将来の地球環境変化は,菌根形成に大きな影響を与えることが予想され,その方面の研究の進展がまたれている。

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アーバスキュラー(VA)菌根菌の進化と環境適応(共生・寄生微生物の進化と環境適応,シンポジウム)

斎藤雅典

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 25-30
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_25

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植物根に共生する糸状菌アーバスキュラー菌根菌(一般にVA菌根菌とも呼ぼれる)の進化について,最近の報告に基づいて論議を行った。アーバスキュラー菌根菌はその形態的特徴から接合菌類Glomales目に分類されている。その分類体系はリボソームRNA遺伝子の塩基配列に基づいた分子系統関係からもほぼ支持されているが,今後,さらに検討を要する部分も残されている。アーバスキュラー菌根共生系の起源は,約4億年前の陸上植物の登場した頃と推定されており,本共生系の進化と適応を,宿主である植物との共進化の観点から考察を加えた。

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ダイズ根粒菌における進化と適応(共生・寄生微生物の進化と環境適応,シンポジウム)

横山正, 安藤象太郎

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 31-44
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_31

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熱帯と温帯のダイズ根粒菌の根粒形成遺伝子のRFLP解析を行った結果,テストした123株(タイ62株,日本46株,米国USDA15株)は4種の系統に分類できた。系統1は米国と日本産のB. japonicumで構成され,系統2は米国・日本及びタイ産のB. elkaniiで構成された。一方,タイ株は系統3と4を占め,温帯及び熱帯アジアに於いては,少なくとも根粒形成遺伝子の違いにより,4系統のダイズ根粒菌が生息することが推定された。18株のタイ産ダイズ根粒菌と13株のUSDA株を用い,根粒形成遺伝子と窒素固定遺伝子のRFLPに基づくクラスター解析を行った結果,B. japonicum種で占有されたクラスター・B. elkanii種で占められたクラスター及びタイ株のみで占められたクラスターが出現すると共に,各系統間の16 S-rRNAの部分塩基配列の比較により,タイの熱帯固有菌は16 S-rRNA遺伝子の部分配列で,B. japonicumとB. elkaniiの中間に位置することが分かった。各系統に属する根粒菌の分布域を調べた結果,B. japonicum種は日本・韓国・中国の温帯域のみで見いだされ,系統3・4はタイ・インドネシア及びインドに分布しており,各系統の分布域に気候帯特異性が存在した。そこで,各系統菌の根粒形成遺伝子の遺伝子発現に対する温度の効果を調べた。その結果,温帯起源の菌は中温域で,また,熱帯起源の菌は高温域で最大の遺伝子発現を示すことが分かり,各気候帯に最も適応したダイズ根粒菌が存在することが裏付けられた。

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Nodulation competitiveness and nitrogenase activity of gusA-marked Rhizobium meliloti in alfalfa

Ui Gum Kang, Vladimir K. Tchebotar, Constancio A. Asis Jr., Ho Sung Ha ...

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 45-49
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_45

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The gusA-marked Rhizobium meliloti YAO 3 M 2 and YAO 3 M 6 mutants were constructed by inserting transposon mTn 5 SSgusA 20 from Escherichia coli S 17-1 lambda-pir into the genome of Rhizobium meliloti YAO 3, a promising acid-tolerant strain with a high nitrogen-fixing ability isolated from Korean soil. Alfalfa (Medicago sativa L.) plants inoculated with the gusA-marked mutant showed a comparable nodule number and nitrogenase activity to those of the plants inoculated with the wild strain, while nodule occupancy by each mutant did not differ from that of the wild strain. These findings suggest that transposon mutagenesis did not alter the characteristics of the parent strain and both gusA-marked mutant strains could be used in the characterization of the nodulation and competitiveness of R. meliloti YAO 3. The colonization of the root surface and inside of the nodule by the gusA-marked mutants was easily determined due to the production of a blue precipitate after incubation of the nodulated roots in the GUS substrate X-gluc, while the unmarked strain was recognized by the presence of unstained bacteroids in the nodules.

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Malate dehydrogenases from nitrifying bacteria : purification and properties

Takashi Masuko, Reiji Takahashi, Tatsuaki Tokuyama

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 51-59
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_51

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Malate dehydrogenases [EC 1.1.1.37, MDH] were purified as electrophoretically homogeneous proteins from Nitrosomonas sp. TK 794 (ammonia-oxidizing bacterium, Ns) and Nitrobacter agilis ATCC 14123 (nitrite-oxidizing bacterium, Nb). The molecular weights of the MDHs were 61.0 kDa (Ns-MDH) and 107.5 kDa (Nb-MDH), respectively, as indicated by gel filtration. Analysis by SDS-PAGE showed that these MDHs apparently consisted of two (Ns-MDH) and three (Nb-MDH) similar subunits with molecular weights of 35.5 and 35.9 kDa, respectively. The MDHs showed oxaloacetate-reducing activity with NAD^+. The K_m of the enzymes for oxaloacetate and NADH were estimated as 67 μM, 25 μM (Ns-MDH) and 74 μM, 53.6 μM (Nb-MDH), respectively. Optimal pH and temperature for the reaction were approximately 6.5-7.0, 60℃ (Ns-MDH) and 8.0-8.5, 45℃ (Nb-MDH), respectively. The enzymes were stable up to 60℃ (Ns-MDH) and 30℃ (Nb-MDH) and in the pH range between 5.5 and 9.5 (Ns-MDH) and 9.0 and 10.0 (Nb-MDH) after standing at 50℃ for 30 min. The Nb-MDH activity was strongly inhibited by N-ethylmaleimide and p-chloromercuribenzoate unlike the Ns-MDH activity. The N-terminal amino acid sequence of Nb-MDH was found to be ARNKIGLIGSGQIGGTLAHLIGLKELGNVVMFNIANGVPQ.

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Comparison of arbuscular mycorrhizal fungal flora under different cropping systems in a Light-colored Andosol of Japan

Toshiyuki Isoi

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 61-64
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_61

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The difference in the composition of the arbuscular mycorrhizal fungal flora under six different cropping systems in a Light-colored Andosol of Japan was investigated. Six cropping systems included 'fallow (weeding)-barley', 'fallow (no weeding)-barley' 'soybean-barley', 'maize-barley', 'cotton-barley' and 'sugar beet-barley'. Total number of spores after the 1 st cropping in the summer season was high in the fallow (no weeding), soybean, maize and cotton plots, and low in the fallow (weeding) and sugar beet plots. Common purslane, Henry crabgrass and common nightshade were dominant in the fallow (no weeding) plots. Pot experiment showed that in the case of Henry crabgrass the number of arbuscular mycorrhizal fungal spores increased significantly. After the 2 nd cropping (barley) in the winter season, a higher number of spores of Glomus spp. was found than after the 1 st cropping. In this study, it was demonstrated that the arbuscular mycorrhizal fungal flora was influenced by cropping systems in a Light-colored Andosol of Japan.

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根圏細菌接種による根こぶ病菌の根毛感染量の変化(1997年度大会一般講演要旨)

相野公孝, 前川和正

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 65-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_65_1

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アーバスキュラー菌根菌の機能発現に及ぼす土壌物理性の影響(1997年度大会一般講演要旨)

山本一輝, 江沢辰広, 吉田重方

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 65-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_65_2

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RFLP of arbuscular mycorrhizal fungi with a probe cloned from Gigaspora margarita(The Annual Meeting of the Society in 1997)

P. Raja, H. Sano, M. Hayatsu, M. Saito

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 66-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_66_1

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レンゲ根粒菌の接種と根粒形成 : RAPDによる根粒形成菌株の判別(1997年度大会一般講演要旨)

田知本正夫

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 66-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_66_2

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青森農試藤坂支場における長期連輪作土壌の微生物性(1997年度大会一般講演要旨)

横山和成, 庄司正, 小山田善三

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 67-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_67_1

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土壌細菌群集における冷却撹乱(1997年度大会一般講演要旨)

横山和成, 庄司正

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 67-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_67_2

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蛍光画像のパソコン処理による環境微生物バイオマスの自動測定(1997年度大会一般講演要旨)

小平芳裕, 染谷孝

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 68-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_68_1

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管理強度が異なるいくつかの土壌の野外における炭素収支(1997年度大会一般講演要旨)

佐藤輝, 瀬戸昌之

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 68-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_68_2

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被覆尿素肥料施用水田における微生物バイオマス窒素の動態(1997年度大会一般講演要旨)

柴原藤善, 犬伏和之, 小松茂雄, 桜井恵子

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 69-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_69_1

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森林と農耕地土壌の微生物バイオマスに及ぼす温度と水分の影響(1997年度大会一般講演要旨)

露崎敏幸, 瀬戸昌之

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 69-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_69_2

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Identification and quantification of auxins in culture medium of Azospirillum and Klebsiella and their effect on rice roots(The Annual Meeting of the Society in 1997)

Hussein El-Khawas, Katsuki Adachi

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 70-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_70

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あのとき,こんなことが(こんなことが,いま)

佐藤匡

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 71-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_71_1

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「土と微生物」50号の発行にあたり(こんなことが,いま)

加藤邦彦

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 71-72
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_71_2

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1997年度大会に参加して(こんなことが,いま)

大矢朋子

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 72-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_72

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パストゥール-世紀を超えた生命科学への洞察-, ルネ・デュボス著, T・D・ブロック編, 長木大三・田口文章・岸田綱太郎訳, 学会出版センター, 1996年, 222頁, 2,500円

森川千春

原稿種別: 本文
1997 年 50 巻 p. 73-
発行日: 1997/10/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.50.0_73

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