-
中澤 晶子
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
79-83
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
土壌細菌と病原細菌をゲノムの面から比較するため,土壌細菌としてトルエン・キシレン分解能を持つPseudomonas putida mt-2と植物に腫瘤を形成するAgrobacterium tumefaciens C58をとりあげ,また,病原細菌としてHelicobacter pylori 26695とBartonella henselae Houston-1を取り上げた。環境細菌は大きいゲノムを持つのに対して,病原細菌は小さいゲノムを持つ。また環境細菌は他の微生物との競争のため多数のrRNAオペロンと多数の調節遺伝子を持つのに対し,競合微生物が少い病原細菌は,rRNAオペロンも調節遺伝子も少ない。さらに環境細菌は,土壌中の栄養を獲得・代謝する経路を発達させ,一方病原細菌は宿主内生息に適応した輸送系・代謝系を持つ。取り上げた細菌の特性/病原性にかかわる遺伝子群はすべて水平伝達により獲得されたものである。すべてType IV分泌装置遺伝子群を備えており,その働きにより,標的細胞(細菌,動物細胞,植物細胞)にエフェクター(タンパク質,DNA)を注入する。これらの最近においては,Tipe IV分泌系が生存戦略の中心となすものと考えられる。
抄録全体を表示
-
福田 雅夫
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
84-88
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
高残留性環境汚染物質であるポリ塩化ビフェニル(PCB)の分解細菌Rhodococcus jostii RHA1株は,放線菌群に属するグラム陽性無芽胞桿菌で,妹尾らにより分離されたγ-HCH(リンデン)分解菌と同じ圃場に由来する。RHA1株においてPCB分解を触媒するビフェニル代謝酵素系では,(1)各分解ステップに複数の同種酵素(アイソザイム)が関与し,(2)5つのオペロンに分散した酵素遺伝子が巨大な線状プラスミドにコードされ,グラム陰性PCB分解菌とは異なるベクトルで分解酵素系を進化させてきたと想像される。RHA1株のゲノム解析はブリティシュコロンビア大学(UBC,カナダ)のグループとの共同研究で進められ,2005年に9.7メガベースの巨大ゲノムのシーケンスが完了し,上述のアイソザイムの分布や,多数のオキシゲナーゼ遺伝子をもつことなどが明らかになった。我々は農業環境技術研究所の小川(現・静岡大学)らとRHA1株の滅菌土壌中での増殖における遺伝子発現を,DNAマイクロアレイ技術を用いて調べ,滅菌土壌中で特異的に発現すると考えられる遺伝子を同定することに成功した。
抄録全体を表示
-
南澤 究, 増田 幸子, 板倉 学, 池田 成志
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
89-92
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
ダイズ根粒菌(Bradyrhizobium japonicum)USDA110株のゲノム情報から推定されたチオ硫酸酸化,芳香族分解系の遺伝子の新規機能を明らかにした。いずれの場合も低濃度の基質が電子供与体となり,重複遺伝子群の一部が機能していた。これらの結果は,ダイズ根粒菌の低栄養環境細菌としての振る舞いを示したものであると考えられた。ダイズ根粒菌の菌株比較より,共生窒素固定能を高めるゲノム領域を同定した。B. japonicumに見いだされたこれらの遺伝子群はBradyrhizobiaceae科やProteobacteriaにも分布しているので,土壌細菌としての隠れた性質を明らかにする一助になると考えられた。また,エンドファイトなどの植物関連細菌の研究において微生物濃縮法の意義を議論した。
抄録全体を表示
-
津田 雅孝, 西山 依里, 宮腰 昌利, 湯原 悟志, 永田 裕二, 大坪 嘉行
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
93-97
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
多様な環境に常在する土壌性のβ-プロテオバクテリアで極めて多様な有機化合物を炭素・エネルギー源にできるB. multivoransの全ゲノム構造を解明し,3.4Mbと2.5Mb, 0.9Mbの環状染色体の複製・分配装置を提示するとともに,プラスミド型の複製・分配装置を持つ後2者の染色体のうち,2.5Mb染色体は土壌生態系で主要炭素源となる様々な芳香族化合物の分解酵素遺伝子群を数多くもつことを見出した。また,本菌の土壌で特異的に発現する遺伝子群とこの環境での生存・増殖に必要な候補遺伝子群の網羅的取得を,各々IVETとSTMの遺伝学的手法で実施し,土壌で特異的に発現する候補遺伝子群の2.5Mb染色体支配の相対的割合が高いことを示した。最後に,土壌で用いてこのような遺伝子群を遺伝学的に同定・解析する際の長所と短所を提示した。
抄録全体を表示
-
加藤 公彦, 伊代住 浩幸, 貫井 秀樹
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
98-101
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
生物が肉眼では観察できないほど弱く発光する現象は,生物微弱発光またはバイオフォトンと呼ばれる。植物はストレスを受けるとバイオフォトンの発生量が増加するため,バイオフォトンはストレスを把握する指標として利用することができる。病害抵抗反応に基づくバイオフォトンは,病害抵抗反応のシグナル伝達経路を通って発生し,また,除草剤処理により発生するバイオフォトンには除草剤の解毒代謝が関与することが判明しており,バイオフォトンの発生メカニズム解析からもバイオフォトン発生とストレス応答との密接な結びつきが示唆されている。ストレスの生体情報であるバイオフォトンを利用して,病害抵抗性誘導剤のスクリーニングシステムと植物の除草剤抵抗性判定法の開発を行った。
抄録全体を表示
-
露無 慎二, 藤川 貴史, 駒井 慶子, 木村 幸, 小松 節子, 平田 久笑
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
102-105
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
Plants have been evolved to obtain the ability to induce the cascade of defense response upon exposure to wide variety of plant pathogens. Disease incidence, thus, should be considered as an exceptional event for the plants. One of the most important mechanisms leading to this exceptional event has been shown to be due to the suppression of the induction of defense response of host plants by the pathogen. At least in the case of bacterial pathogens, we found that this suppression was shown to be elicited by most of the avirulence (avr) genes. This rather unexpected finding (ie. dual function of avr genes) has opened a new strategy to construct the plant resistant to any plant diseases by escaping from the suppressor activity conferred by avr gene.
抄録全体を表示
-
甘利 誠, 豊田 剛己, Tajul MD Islam, 増田 和成, 黒田 哲生, 渡辺 昭
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
106-113
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
メタン消化液は今後有効利用が期待される有機物であり,本論文では土耕栽培や養液栽培においてメタン消化液の各種病害に対する影響を評価した。土壌ではメタン消化液の10%(v/w)施用によりトマト青枯病の発病程度が3.3から0,2に低下し,青枯病菌密度の減少や高い微生物活性が認められた。20%施用ではレタス根腐病の発病程度が2.7から1.4に低下した(枯死=4,健全=0)。メタン消化液施用はトマト,レタスいずれの生育も阻害せず,むしろ両作物の生育が良好となった。軽石培地を用いた養液栽培では,トマト青枯病やサラダナおよびホウレンソウ苗立枯病の発病抑制,サラダナ根腐病の発病遅延が見られた。フィルター除菌したメタン消化液それに含まれる濃度と同一濃度のアンモニアや酢酸を混合した寒天培地では青枯病菌やレタス根腐病菌の生育が有意に抑制され,メタン消化液中の化学成分が病害抑制に直接関与している可能性が示唆された。これらの結果より,メタン消化液は土壌病害抑制資材として,また有機質肥料としての機能を有することが推察された。
抄録全体を表示
-
川浦 慶, 大塚 重人, 西山 雅也, 妹尾 啓史
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
114-120
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
土壌DNAからPCR法やライブラリー法により遺伝子を取得する方法は,培養困難な微生物が大部分を占める土壌微生物からの産業上有用な遺伝子・遺伝子産物の取得法として有効である。この際に,土壌DNAの分離源として生成分類や利用形態,肥料や農薬の施用体系,人為的処理が異なる土壌を用いることが,より多様な有用遺伝子の取得につながるのではないかと予測し,本実験を実施した。堆肥連用土壌TPN/γ-HCH/堆肥連用土壌,針葉樹林土壌(以上黒ボク土)ならびに果樹園土壌(褐色森林土)をそのまま,あるいはナフタレン・フルオレンを添加してインキュベートした。各土壌からDNAを抽出し,芳香環水酸化ジオキシゲナーゼ遺伝子を標的としたPCRを行い,PCR産物をT-KELP解析に供する一方,ナフタレン・フルオレンを添加した針葉樹林土壌に由来するPCR産物をクローニング・シーケンスした。用いた土壌間でT-RFLPパターンが異なり,ナフタレン・フルオレンを添加した場合にはパターンの相違がより顕著になった。クローンのシーケンス,系統解析からも,多様なジオキシゲナーゼ遺伝子の取得が確認され,当初の予測の妥当性が示された。
抄録全体を表示
-
須賀 有子, 堀 兼明, 小森 冴香, 福永 亜矢子, 池田 順一, 豊田 剛己
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
121-125
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
植物根から迅速・簡便かつ安価にDNAを抽出する手法として,ガラスビーズで細胞破砕を行うビーズ法が適当であるか,またビーズ法で抽出されたDNAが細菌の16S rDNAのPCR-DGGE解析による細菌群集構造解析に供試可能かどうかを検討した。また,ビーズ法と他のDNA抽出法について,抽出DNA量やDGGEパターンの比較を行った。その結果,約5mmに切断した根を0.1gビーズ法に供試することで,根に生息する細菌のDNA抽出およびDGGEパターンを得ることは十分に可能であった。ビーズ法とCTAB法およびDNA抽出キットを用いてDNA抽出を行ったところ,抽出DNA量はビーズ法を用いた場合が最も多く,DGGEパターンはDNA抽出法による大きな違いは見られなかった。以上の結果から,ビーズ法が細菌群集構造解析のための植物根からの迅速かつ簡便なDNA抽出法として適していると考えられた。
抄録全体を表示
-
Hitoshi Nakamura, Atsuko Sasaki, Koji Yoshida, Takanori Shimane
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
126-129
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
A baiting method using Lupinus luteus was applied to the relative estimation of the inoculum density of the white root rot fungus, Rosellinia necatrix in soil. Chips (20 g in dry weight) of dormant twigs of Japanese pear colonized by the fungus were serially diluted with 5 L of an orchard soil and incubated for a week. Thirty seeds of L. luteus were sowed at 5 cm intervals into the infested soil, and the plants were grown at 25 ℃ in a greenhouse during a month. Infection on the plants was then checked. Necrotic and/or rotten legions were observed on the hypocotyls and/or tap roots. There was a significant correlation between the dilution rate of the inoculum and the detection frequency of the white root rot fungus in artificially infested soil. This method is considered to be useful for estimating the inoculum density of the white root rot fungus in field soil.
抄録全体を表示
-
武田 容枝
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
130-131
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
和田 さと子
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
131-132
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
服部 勉
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
132-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
堀田 光生, 吉田 隆延, 土屋 健一
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
133-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
浅川 晋, 渡邉 健史, 木村 眞人
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
133-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
吉岡 千津, 平野 泰志, 對馬 誠也, 斎藤 雅典, 寺岡 徹, 有江 力
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
133-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
西澤 智康, 小松崎 将一, 金子 信博, 太田 寛行
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
133-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
新谷 政己, 松井 一泰, 山根 久和, 野尻 秀昭
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
134-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
千野 裕之, 安達 舞, 李 哲揆, 犬伏 和之
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
134-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
橋本 知義, 橋爪 沙耶香, 染谷 孝
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
134-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
宍戸 雅宏, 横山 秀美, 須田 亙, 牛尾 進吾
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
134-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
藤井 久美子, 神谷 敏広, 久我 ゆかり
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
135-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
横山 和平, 安次富 枝里子, 本田 理, 湯村 正典
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
135-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
奈良 吉主, 加藤 孝太郎, 田渕 浩康, 河原崎 秀志, 有江 力, 寺岡 徹, 木嶋 利男
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
135-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
藤村 玲子, 佐藤 嘉則, 長澤 俊樹, 細川 研, 西澤 智康, 難波 謙二, 加藤 拓, 片山 葉子, 上條 隆志, 東 照雄, 太田 ...
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
135-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
Marylene Posas, Koki Toyota
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
136-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
Yanetri Asi Nion, Koki Toyota, Takeshi Igawa
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
136-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
藤原 伸介, 安藤 拓哉, 梅島(澤田) 寛子
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
136-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
川浦 慶, 大塚 重人, 西山 雅也, 妹尾 啓史
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
136-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
増中 章, 百町 満朗, 竹中 重仁
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
137-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
古山 雅智, 大西 純一
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
137-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
及川 純一, 村松 康行, 坂本 一憲, 天知 誠吾
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
137-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
岡 紀邦, 建部 雅子, 岡崎 圭毅, 岡本 美輪
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
137-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
中山 奈津子, 浅川 晋, 木村 眞人
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
138-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
渡邉 健史, 木村 眞人, 浅川 晋
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
138-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
Dhanapati Neupaney, Masaki Watanabe, Hiroshi Futsuta, Maki Kimura, Shu ...
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
138-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
松本 卓生, 田中 慶昌, 古賀 成司
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
138-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
松本 卓生, 田中 慶昌, 古賀 成司
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
139-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
昭日 格図, 西澤 智康, 佐藤 嘉則, 小松崎 将一, 太田 寛行
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
139-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
村瀬 潤, Peter Frenzel
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
139-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
Guanghua Wang, Motoki Hayashi, Masato Saito, Kazunari Tsuchiya, Susumu ...
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
139-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
村上 弘治, 畔柳 有希子
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
140-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
酒井 順子, 藤井 毅
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
140-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
片岡 良太, 谷口 武士, 二井 一禎
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
140-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
梅津 昌史, 佐藤 嘉則, 西澤 智康, 新美 洋, 橋本 知義, 小松崎 将一, 太田 寛行
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
140-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
安田 智昭, 梅津 昌史, 鶴田 和人, 西澤 智康, 佐藤 嘉則, 高原 義治, 太田 寛行
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
141-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
出口 奈吾, 境 雅夫
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
141-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
中村 結, 善本 さゆり, 金田 吉弘, 佐藤 孝
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
141-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
関口 博之, 増中 章, 竹中 重仁
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
141-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー
-
冨樫 智, 尾花 昭平, 犬伏 和之
原稿種別: 本文
2008 年 62 巻 2 号 p.
142-
発行日: 2008/10/30
公開日: 2017/05/31
ジャーナル
フリー