土と微生物

土壌微生物研究の「見える化」

齋藤雅典

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 1-2
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_1

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荒廃土壌におけるススキの生育に及ぼす陸生ラン藻マット「イシクラゲ」施用の影響

河野伸之, 横山和平, 斎藤雅典, 丸本卓哉

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 3-10
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_3

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養分の乏しい荒廃土壌のマサ土や火砕流堆積物において,ススキの生育に及ぼすイシクラゲ施用の影響を調査するため,室内にてポット試験を行った。両土壌ともに,3または4か月の栽培期間を通して,ススキ1本あたりの草丈は,滅菌イシクラゲ施用区,イシクラゲ施用区,硝安施肥区,無施用区の順に高く推移した。試験開始3または4か月目のススキの全乾物重は,イシクラゲ施用区と硝安施肥区でほとんど同じ値を示し,滅菌イシクラゲ施用区は最も高い値を示した。これらの栽培期間中におけるススキの成長量の増加は,窒素の動態の結果より,滅菌イシクラゲ施用区は,イシクラゲ中に含まれる有機態窒素が灌水により下層の土壌中に流下したり,無機化されたりしたことにより,イシクラゲ施用区は,イシクラゲを構成するNostoc sp.によって固定された窒素が土壌中に分泌されたり,イシクラゲ自体が無機化されたりしたことによると考えられた。これらのことから,イシクラゲは,窒素などの養分の欠乏した荒廃土壌での植生の早期回復において,効果的な窒素の供給源になりうることや,生きた状態のイシクラゲは,荒廃土壌の生態系全体の窒素の増加に有効であるといえる。

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トウガラシマイルドモットルウイルス(Pepper mild mottle virus)の感染を抑制する土壌微生物の分離・同定及び土壌伝染抑制効果

池頭靖夫, 野口勝憲, 浜田博幸, 津田新哉

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 11-17
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_11

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本研究では,ピーマンのウイルス病害であるPepper mild mottle virusの土壌伝染を生物防除する為,作物栽培土壌より分離した根圏微生物253菌株の中からウイルス不活化能を持つ3菌株を選抜した。In vitro試験やポット試験で高い土壌伝染抑制効果を示したM-21とC-176は,それぞれB. megateriumとR. pickettiiと同定された。資材化したM-21は,隔離床試験において単独処理でも土壌伝染抑制効果が見られ,C-176培養液の浸漬処理との組み合わせにより,その効果が高まる事が認められた。

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CTC-SYBR Green I二重蛍光染色法による土壌中の呼吸活性陽性菌の定量

龍田典子, 王暁丹, 上野大介, 井上興一, 染谷孝

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 18-24
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_18

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環境中の呼吸活性を持つ細菌を定量する方法に,5-cyano-2,3-ditolyl tetrazolium chloride (CTC)法がある。この方法では,呼吸鎖と共役して還元され細胞内に沈着したCTC-ホルマザン粒子を蛍光顕微鏡下で検出する。本研究では,全細菌を検出するSYBR Green I (SG)をCTCと併用したCTC-SG二重蛍光染色法(CTC-SG法)の土壌試料への適用を検討した。E. coliなど5種の新鮮培養細胞をCTC-SG法に供試すると,良好な染色性(全細胞の62〜95%)が認められた。このとき,CTC-ホルマザン粒子が1細胞上に複数個存在する場合や細胞外にも存在する場合が認められ,従来のCTC単染色法ではこれらも含めて計数されるため,1.2〜1.6倍過大評価となった。水田および畑土壌中のCTC-SG法による呼吸活性陽性細菌数は全菌数の10〜12%に相当し,培養可能な細菌数の1.5〜5.2倍であった。以上の結果から,CTC-SG法は,CTC単染色法の欠点を改善し,土壌中の呼吸活性を有する生きた細菌の定量に適用できることが示唆された。

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土壌リンの存在形態と生物循環

武田容枝

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 25-32
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_25

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リン酸肥料の消費量を削減するために堆肥や緑肥などの有機質資材を利用することが望まれるが,資材施用後のリン動態に関する情報は不足している。化学肥料や動物性資材を施用した土壌ではリンが蓄積しており,蓄積リンの有効活用が課題となっている。有機質資材は土壌微生物の重要な炭素源である。微生物の中には蓄積リンを溶解または分解できるものも存在し,微生物の活性化は蓄積リンの有効化につながると考えられる。微生物に吸収されたリンは細胞溶解や捕食者の摂食により放出される。微生物を介したリンの代謝回転は炭素や窒素よりも速く,リンの固定を抑制する効果がある。また,有機質資材を用いた土壌におけるリンの代謝回転は化学肥料施用土壌よりも速いことが示されており,微生物によるリン循環が植物栄養上いかに重要であるか推察される。微生物バイオマスリンの定量法にはいくつか問題点があるが,その改良によってトルオーグ法やプレイ法では評価できない微生物を介したリンフラックスのより正確な評価が可能となる。さらに,圃場レベルで微生物バイオマスリンと作物リン吸収との関係を追求し理解を深めることが有機質資材の有効利用につながると考える。

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末端制限断片(T-RFs)プロファイル情報に基づく土壌微生物群集構造解析

西澤智康, 小松崎将一, 金子信博, 太田寛行

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 33-40
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_33

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土壌環境中に存在する微生物の多様性や土壌環境変化への微生物群集の応答を調べるため,リアルタイム定量PCRアッセイと末端制限断片長多型解析(T-RFLP)法を併用した手法を確立した。この解析手法から,標的遺伝子領域に基づく微生物群の末端制限断片(T-RFs)サイズとピーク高(相対値)の情報が得られる。T-RFLPプロファイリングの実測情報とクローン解析から得られた遺伝子配列のin silico解析によるT-RFsプロファイル情報がほぼ一致することから,本法が精度の高い解析技術であることを示した。また,検出されたT-FRsプロファイル情報をもとに多次元尺度構成法分析で微生物群集の類似性とその動態を表す方法,そしてT-RFsの相対的存在量の頻度分布順位図から微生物の多様性を示す方法を紹介した。さらに,T-RFsプロファイル情報をもとに土壌微生物群集を推定するバイオインフォマテッィクスの利用方法を示した。今後のデータベースの充実により,定量PCR-T-KELP法が土壌微生物群集モニタリングに大いに役立つことを期待している。

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T-RFLP法による土壌生物群集の多様性解析(実験法)

大場広輔, 岡田浩明

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 41-48
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_41

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2009年度土壌ゼミ合宿(こんなことが,いま)

柳井洋介

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 49-50
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_49

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MARCOシンポジウム2009ワークショップ5「農業研究におけるメタゲノミクスの展望」に参加して(こんなことが,いま)

渡邉健史

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 50-51
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_50

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ESAFS9(第9回東アジアおよび東南アジア国際土壌科学会議)に参加して(こんなことが,いま)

坂本一憲

原稿種別: 本文
2010 年 64 巻 1 号 p. 51-52
発行日: 2010/04/01
公開日: 2017/05/31

DOIhttps://doi.org/10.18946/jssm.64.1_51

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