生物物理化学
Online ISSN : 1349-9785
Print ISSN : 0031-9082
ISSN-L : 0031-9082
49 巻, 1 号
選択された号の論文の3件中1~3を表示しています
  • 森居 隆史, 岡田 孝夫
    2005 年 49 巻 1 号 p. 1-3
    発行日: 2005/03/15
    公開日: 2009/03/31
    ジャーナル フリー
    Visualization and measurement of biomolecules based on an atomic force microscope (AFM) allow us to observe individual molecules in their native form. Because the measurement can be performed in buffer solution and it does not require fluorescence labeling or staining. This technique could be applied for the detection of bound site of MutS protein to DNA successfully. Recent developments in AFM technology such as a low noise nano-positioning sensor for closed-loop operation have opened the door to new era of single molecule manipulation. We demonstrate that we can take aim at a portion of DNA adsorbed on mica substrate and we can fish it up with an AFM tip.
  • 松田 悦利, 恵比須 省吾
    2005 年 49 巻 1 号 p. 5-9
    発行日: 2005/03/15
    公開日: 2009/03/31
    ジャーナル フリー
    The post-genomic era brings with it many challenges to the understanding of protein structure, function and interaction. The increasing number of newly identified proteins that need to be expressed, problems associated with cell cultivation, and traditional sub-cloning procedures are some of the key bottlenecks.
    Rapid Translation System “RTS” is a scalable in vitro transcription/translation protein expression platform, that produces sufficient amounts of protein for characterization studies, functional assays, or structural analysis. RTS offers the advantages of a cell-free protein expression system, eliminating the need for laborious up- and down-stream steps (e.g. host cell transformation, culturing, or lysis) typically associated with cell-based expression systems.
    Generally, to further fasten the protein expression screening, we recommend to use linear (PCR-generated) templates with the RTS screening kits. These templates are produced via the RTS Linear Template Generation Sets. For scale-up with RTS500 (1ml reaction) and RTS9000 (10, 30ml reaction), the use of circular templates is recommended, which are generated with the RTS pIVEX Vector Sets. In order to yield mg quantities, expressions should be performed using the RTS ProteoMaster instrument.
    For optimization of the prokaryotic Rapid Translation, we offer a special software, the ProteoExpert RTS E. coli HY. The software delivers high-yield variants of an input ORF sequence.
  • 新井 悦郎, 鷹井 宏
    2005 年 49 巻 1 号 p. 11-16
    発行日: 2005/03/15
    公開日: 2009/03/31
    ジャーナル フリー
    臨床の場における疾患マーカとして, もしくは医薬品開発におけるターゲットとして, 疾病状態に特異的に発現されるタンパク質を特定する作業が病態プロテオミクスとして注目されている. この比較研究用に, pH勾配によるイオン交換法と逆相法を組合わせた2D-LCによる蛋白質2次元展開法が開発され, その概要と分析事例を紹介した. 癌組織や血漿において, 発現に差の認められるタンパク質が検出された. 分画後のMALDI-MSによる同定も行われている.
    一方, ここで見出されたタンパク質の同定や, 付随する糖鎖の解析も重要な課題であり, この分野でのCE-MSの応用にも触れた. トリプシン消化物におけるタンパク質同定, 誘導体化された糖鎖の構造解析を行った. 糖鎖についてはCE-LIFとの組合わせにより, さらに詳細な構造解析が可能なことが示された.
feedback
Top