データベースに蓄積の著しい機能未知のタンパク質類の機能推定のための自己組織化マップ法の開発

抄録

生物学的また産業的に重要な新規タンパク質遺伝子を発掘することを目的に、メタゲノム解析が進行中である。新規性の高い遺伝子の場合、アミノ酸配列の相同性検索でタンパク質の機能推定が困難な例が多い。一括学習型自己組織化マップ法(BL-SOM)を用いて、データベースに収録された機能既知の大量なタンパク質を対象に2～4連アミノ酸頻度のBL-SOMを試みたところ、タンパク質が機能により分離(自己組織化)する傾向を示した。