E.coli K12におけるterminator配列の探索

抄録

オペロンの下流に存在するターミネータ領域の探索を行った。RNAの構造解析に使用されるドットマトリックス法において、自由エネルギーを評価値として用いることで、ターミネータ領域探索法を構築した。E.coli K12の各遺伝子領域の下流60塩基配列のターミネータ解析を行ったところ、スコアの高いものと低いものがみつかった。前者はρ-非依存性、後者はρ-依存性ターミネータに相当するものと思われる。