大規模FMO解析に基づくファーマコフォアモデルの構築

安尾 信明; 吉野 龍之介; 稲岡 ダニエル 健; 萩原 陽介; 大野 一樹; 折田 正弥; 北 潔; 関嶋 政和

doi:10.11545/ciqs.2015.0_116

第38回ケモインフォマティクス討論会　東京

DOI https://doi.org/10.11545/ciqs.2015.0_116

会議情報

主催: 日本化学会情報化学部会

共催: 日本薬学会, 日本農芸化学会, 日本分析化学会, 日本コンピュータ化学会

ポスター発表

大規模FMO解析に基づくファーマコフォアモデルの構築

*安尾信明, 吉野龍之介, 稲岡ダニエル健, 萩原陽介, 大野一樹, 折田正弥, 北潔, 関嶋政和

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キーワード: ファーマコフォアモデリング, Structure-based drug design, フラグメント分子軌道(FMO)法

会議録・要旨集フリー

p. 116-119

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抄録

創薬において，活性化合物に重要な特性を抽出したファーマコフォアモデルを構築することは，新規活性化合物獲得の観点で有用である．本研究では，熱帯病の一種シャーガス病を引き起こす原虫Trypanosoma cruziのジヒドロオロト酸デヒドロゲナーゼ (TcDHODH)を標的とし，非経験的量子化学計算を行うフラグメント分子軌道(FMO)法を用いてファーマコフォアモデルを構築した．TcDHODHと基質であるオロト酸，既知の阻害剤であるオキソン酸，阻害活性をもつ43種のオロト酸誘導体それぞれとの相互作用を計算し比較した結果，ファーマコフォアとなる4点の共通した相互作用と1点の特徴的な相互作用が得られた．また，この特徴的な相互作用はHuman DHODHとの特異性をもたらす可能性も示唆された．

責任著者(Corresponding author)

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