タンパク質の二次構造主成分分析：プリオン形成中間体の構造状態

抄録

プリオン病は正常型プリオンタンパク質（PrPC）が病原性異常型（PrPSc）に変化した結果，複数のPrPScが凝集することで分子間βシート構造を骨格とするアミロイド線維を形成し，脳内に沈着することで発症する．プリオン病の初期過程ではPrPCの一部分が変性した過渡的中間体PrP*がPrPScへの構造変化を橋渡しする役割を担う．したがって，プリオン病の機序を解明するための手掛かりは，このプリオン形成中間体PrP*にある．本研究ではPrP*の構造的特徴を抽出する手段として，二次構造情報に基づく新しいカーネル主成分分析（SSPCA; Secondary Structure PCA）を開発した．SSPCAを適用することで，プリオン形成中間体PrP*の有力な候補として，PrPCの構造の一部がヘリックス→ストランド転位した特徴的な変性状態を明らかにした．