マルチPSIを利用したタンパク質の配列モチーフ抽出

抄録

確率的探索アルゴリズムである遺伝アルゴリズムと記述長最小 (MDL) 基準を用いた、タンパク質の配列モチーフ抽出プログラムを、第五世代コンピュータプロジェクトで開発した並列推論マシン「マルチPSI」上に開発し、そのプログラムを使用して、実際のタンパク質の配列モチーフ抽出を行った。本稿では、タンパク質の配列モチーフ抽出の結果と並列化による台数効果について報告する。