次世代DNAシーケンシングによる森林分子生態学的研究

抄録

近年開発されたデスクトップ型次世代DNAシーケンサーの普及は、特に非モデル生物を扱う分子生態学的研究分野で、当該技術を利用する際に大きな障害となっていたコスト面等の問題を、一気に解消しつつあると言える。一方で、一般的な分子生態学的研究の多くでは、ゲノム解読で用いられるような「桁違い」のデータ量を必ずしも必要としないことがあり、この分野では次世代シーケンシング技術を有効に活かしきれていない状況も見受けられる。また、「桁違い」のマーカー数で集団遺伝学的な解析が可能になるRAD-seq（restriction-site-associated DNA sequencing）法は、この分野で最も応用が期待される技術の1つであるが、分析対象DNAのさまざまな条件によって、現実的にはその適用が難しい場合もある。演者らは、これらの問題を解決すべく、RAD-seq法に代わりうる簡便で応用範囲の広い新手法を考案し、開発を進めてきた。本講演では、この新手法によってこれまでに得られた成果を紹介し、その利用可能性や問題点等について議論し、森林分子生態学的研究分野における次世代シーケンシング技術の普及に貢献したいと考えている。