Sporothrix schenckiiはミトコンドリアDNAのrestriction fragment length polymorphism (RFLP)分析によりこれまで24のmtDNAタイプ(Type 1~Type 24)に分けられ,mtDNAタイプの系統樹によりA,Bの2群に大別された.A群に属する菌株は南アフリカ,北米,中米,南米に多く,B群に属する菌株はオーストラリア,日本,中国に多い.S.schenckii臨床分離株は全てRFLP分析によりS.schenckiiと確認されたが,従来の形態学的方法により同定された自然界分離株ではS.schenckiiは少なく,多くはS.schenckiと似た他種であることが判明した.自然界分離株の同定には分子生物学的検討を要すが,臨床分離株ではその必要がないことが示された.