抄録
シグマ因子は、RNA polymerase (RNAP) 酵素複合体において、遺伝子プロモーター配列の認識特異性を与えるサブユニットである。光合成微生物である藍藻 PCC 6803株では、全部で 9種類のシグマ因子遺伝子(sig)が同定されており、それらはグループ1型(sigA)、2型(sigB, sigC, sigD, sigE)および 3型(sigF, sigG, sigH, sigI)に分類されている。各シグマ因子が生体内でどのような遺伝子のプロモーター配列を認識しているかは、機能特性を考察するうえで重要である。最近我々は、抗体や遺伝子破壊株を用いた in vivo 解析、ならびに精製 RNAPを用いた in vitro mRNA合成法などを駆使して、各シグマ因子遺伝子の機能を徐々に明らかにしている。例えば、SigBは熱ショックや暗黒条件下で誘導される遺伝子プロモーター配列を、SigDは光誘導性遺伝子のプロモーター配列を、SigC(或いは SigB/SigE)は窒素代謝プロモーター配列を認識している。そしてこれらグループ 2型シグマ因子は、主要シグマ因子である SigA と共存共役しているが、環境変化に応じて SigA から SigB~SigE への「シグマ因子の置換」を行い、目的遺伝子からの転写誘導をスムーズに行っていると考えられる。また、これまで未知であったグループ 3型シグマ因子により認識される遺伝子のプロモーターに関しても議論したい。今回はこれらをまとめ、プロモーターのクラス分けを紹介する。