2012 年 28 巻 1 号 p. 1-9
タイの発酵食品に存在する乳酸菌の多様性を調べるために,タイの東北部,中部,および北部南寄りの地域から114 の様々な発酵食品を収集し,945株の乳酸菌を分離した.更なる解析に供するため,決定した16S rRNA 遺伝子配列と分離源情報に基づいて410 株を選抜した.16S rRNA 遺伝子配列に基づく解析の結果,分離株はAerococcus 属,Enterococcus 属, Lactobacillus 属,Pediococcus 属,Tetragenococcus 属,Weissella 属の6属に近縁な50の配列グループに分かれた. Aerococcus 属に近縁だった1 株は,A. viridans の配列と100%の相同性を示した.46 株がEnterococcus 属に含まれ,それぞれE. avium,E. faecalis,E. faecium,E. hirae,E. thailandicus,E. gilvus/E. raffinosus に近縁な6グループに分かれた.Lactobacillus 属に含まれた309株は34の配列グループに分かれた.殆どの分離株は既知種の配列と100%の相同性を示したが,8つのグループに属する12株は99.0%以下のやや低い相同値を示し,新種である可能性が示唆された.Pediococcus 属に含まれたのは3グループの38 株で,その1 つはP. acidilactici に,他の2 グループはP. pentosaceus に近縁だった.4 株がTetragenococcus halophilus に近縁だった.Weissella 属に含まれた12 株はW. cibaria,W. confusa,W. paramesenteroides,W. thailandensis,W. viridescens の5 種のいずれかに近縁だった.この研究で分離した株は,タイのBIOTEC culture collection(BCC)と NITE Biological Resource Center(NBRC)の両コレクションから入手することができる.