農業集落を構成する世帯数が2000年から減少局面に入っており，小規模な集落が急増している．この動きは，集落の機能や活動を低下させる一つの要因となっており，特に山間農業地域で顕著である．
他方で，1990年から2010年の間に消滅した農業集落の数はごく僅かであった．しかし，コーホート分析によると，「存続危惧集落」が現在の３千集落から2050年には１万３千集落に増加し，山間農業地域では４分の１を超えると見込まれた．
これら分析結果は，このまま何もしなければ，集落をベースとした様々な活動が，近い将来多くの農業集落で継続できなくなることを示唆している．
