生命科学領域知識基盤構築に向けたオントロジー開発とCOVID-19機序解明に向けた取り組み

抄録

生命科学領域では知識共有を目指してオントロジーの開発が盛んである．しかし，知識の蓄積が浅いテーマについては，一貫性をもった知識の体系化が課題となりそのままでは知識の相互運用も困難となる．そこで，本研究では新知識を体系的に定義し，既存知識への積み上げを可能とする知識基盤の構築を目指す．そして，その実現に向けて生命活動の中心となる生命の恒常性とその破綻に注目し，ホメオスタシスインバランスプロセスオントロジー（HoIP）を開発する．本オントロジーは，上位オントロジーを参照し，恒常性破綻に関する概念まで特殊化することで，生命科学横断的な体系化を一貫的に行う．次に，COVID-19について現実社会の要請に応じた新たな知識の蓄積に取り組む．COVID-19機序解明には感染症学をはじめ，免疫学，分子生物学等幅広い専門領域から感染における一連のメカニズムを説明することが不可欠である．本研究ではCOVID-19におけるウイルス作用と生体防御作用との恒常性破綻による進行過程について粒度横断的に概念を組織化する．さらに，ワクチンをはじめ既存のオントロジーとの関連知識の知識統合による重症化リスク低減を目指す．