QM/MM法に基づいた溶液系のプロトン移動シミュレーション

抄録

水素イオンは生体分子の理解に重要だが，分子シミュレーションにおいて最も取り扱いが難しい対象で，従来小さな系でのダイナミクスしか再現できなかった．今回，ハイブリッド分子モデルQM/MM法を拡張することでバルクでのプロトン輸送を再現した．これによりタンパク質など巨大系のプロトン輸送も取り扱い可能になる．