Negative Fragmentation Approachと密度汎関数法で迫るヘリックス構造における主鎖水素結合エネルギー

生物物理

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総説

Negative Fragmentation Approachと密度汎関数法で迫るヘリックス構造における主鎖水素結合エネルギー

近藤寛子, 鷹野優

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キーワード: hydrogen bond, negative fragmentation approach, secondary structure, DFT

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2024 年 64 巻 2 号 p. 89-93

DOI https://doi.org/10.2142/biophys.64.89

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抄録

水素結合はタンパク質の二次構造形成において必要不可欠な要素の1つである．我々の研究は，ヘリックス中の水素結合は単離されたものと比べて不安定であることを明らかにした．この不安定化は，水素結合のドナーおよびアクセプターが隣接するペプチド基の影響で脱分極することに起因している．

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