四体ポテンシャルを用いたタンパク質活性部位の探索

増田 尚之; 孫 林玉; 後藤 仁志; 相田 拓洋

doi:10.11545/ciqs.2010.0.JP14.0

第33回情報化学討論会　徳島

DOI https://doi.org/10.11545/ciqs.2010.0.JP14.0

会議情報

主催: 日本化学会情報化学部会

共催: 日本薬学会, 日本農芸化学会, 日本分析化学会, 日本コンピュータ化学会, 教育システム情報学会 (協賛)

ポスター発表

四体ポテンシャルを用いたタンパク質活性部位の探索

*増田尚之, 孫林玉, 後藤仁志, 相田拓洋

著者情報

キーワード: 活性部位, 分子認識, DefPol法, ドロネー四面体分割, 4体ポテンシャル法, 貯水池注水アルゴリズム

会議録・要旨集フリー

p. JP14

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抄録

本研究では，タンパク質の立体構造の中で近接している4つのアミノ酸残基の組み合わせについて，その出現頻度を統計処理することで開発された4体ポテンシャル法を用いて，タンパク質の表面上で最も出現しやすいアミノ酸残基やペプチド配列を探索する．これによって，そのタンパク質の活性部位の候補，およびそこに最も結合しやすいペプチド配列とその立体構造を特定するシステムを開発する．

責任著者(Corresponding author)

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