遷移状態データベースを利用した多数の薬候補化合物合成反応の解析

抄録

我々のプロジェクトでは、(1)薬物候補化合物の大規模バーチャルライブラリを作成し、(2) 予測モデルを用いたスクリーニングによる絞り込み、(3)絞り込まれた多数の化合物の合成 の可能性を遷移状態探索により検討する。我々は、短時間で多くの候補化合物の反応解析を 行う目的で遷移状態データベースを構築し、その利用方法と理論計算とを繋げる TSDB ク ラウドシステムの構築を行ってきた。このシステムは、データベース検索と理論計算を行う クラウドシステムと、Windows 上で Web ブラウザを通したクラウドシステムとの間のイン ターフェイス(cStructure)と Gaussian プログラム入力作成プログラム(iStructure)で構成 される。本研究では、システムの概要を述べるとともに、PME-1 タンパク質活性を阻害す る可能性のある複数の薬物候補化合物合成反応に対して行った解析結果について述べる。