Current Status and Future of the ABINIT-MP Program

Abstract

The fragment molecular orbital (FMO) program ABINIT-MP has a quarter-century history, and related research and development of the Open Version 2 series is currently underway. This paper first summarizes the current status of the latest Revision 8 (released on August 2023). It then describes future improvements and enhancements, including GPU support. The connection with coarse-grained simulation (dissipative particle dynamics) and the possibility of cooperation with quantum computation are also touched upon.

Translated Abstract

The fragment molecular orbital (FMO) program ABINIT-MP has a quarter-century history, and related research and development of the Open Version 2 series is currently underway. This paper first summarizes the current status of the latest Revision 8 (released on August 2023). It then describes future improvements and enhancements, including GPU support. The connection with coarse-grained simulation (dissipative particle dynamics) and the possibility of cooperation with quantum computation are also touched upon.

Tables

Table 1.  Status of library installation at HPCI sites as of July 2024.

Table 2.  Acceleration of integral generation for Chignolin (HF/6-31G).

Table 3.  Acceleration of CASCI calculation for CH₂ (DZP).

参考文献

• [1]   K. Kitaura, E. Ikeo, T. Asada, T. Nakano, M. Uebayasi, Chem. Phys. Lett., 313, 701 (1999). doi:10.1016/S0009-2614(99)00874-X
• [2]   D. G. Fedorov, K. Kitaura, ed., "The Fragment Molecular Orbital Method: Practical Applications to Large Molecular Systems", (2009), CRC.
• [3]   Y. Mochizuki, S. Tanaka, K. Fukuzawa, ed., "Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method", (2021), Springer.
• [4]   M. W. Schmidt, K. K. Baldridge, J. A. Boatz, S. T. Elbert, M. S. Gordon, J. H. Jensen, et al., J. Comput. Chem., 14, 1347 (1993). doi:10.1002/jcc.540141112
• [5]D. G. Fedorov, WIREs Comp. Mol. Sci. (2017) e1322.https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/wcms.1322
• [6]   D. G. Fedorov, pp. 31-51, in "Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method", 2021, Springer.
• [7]   T. Ishikawa, T. Ishikura, K. Kuwata, J. Comput. Chem., 30, 2594 (2009). doi:10.1002/jcc.21265 PMID:19408278
• [8]   T. Ishikawa, pp. 69-76, in "Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method", 2021, Springer.
• [9]   T. Nakano, T. Kaminuma, T. Sato, Y. Akiyama, M. Uebayasi, K. Kitaura, Chem. Phys. Lett., 318, 614 (2000). doi:10.1016/S0009-2614(00)00070-1
• [10]   T. Nakano, T. Kaminuma, T. Sato, K. Fukuzawa, Y. Akiyama, M. Uebayasi, et al., Chem. Phys. Lett., 351, 475 (2002). doi:10.1016/S0009-2614(01)01416-6
• [11]   S. Tanaka, Y. Mochizuki, Y. Komeiji, Y. Okiyama, K. Fukuzawa, Phys. Chem. Chem. Phys., 16, 10310 (2014). doi:10.1039/C4CP00316K PMID:24740821
• [12]   Y. Mochizuki, T. Nakano, K. Sakakura, Y. Okiyama, H. Watanabe, K. Kato, et al., pp. 53-67, in "Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method", 2021, Springer.
• [13]   T. Takami, J, Maki, J. Ooba, Y. Inadom, H. Honda, R. Susukita et al., AIP Conf. Proc. 963 (2007) 122.
• [14]   H. Kitoh-Nishioka, H. Umeda, Y. Shigeta, pp. 77-90, in "Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method", 2021, Springer.
• [15]   Y. Mochizuki, K. Sakakura, Y. Akinaga, K. Kato, H. Watanabe, Y. Okiyama, et al., J. Comput. Chem. Jpn., 16, 119 (2017). doi:10.2477/jccj.2017-0051
• [16]   H. Watanabe, S. Sato, K. Sakakura, S. Saito, Y. Mochizuki, J. Comput. Chem. Jpn., 17, 147 (2018). doi:10.2477/jccj.2018-0023
• [17]   Y. Mochizuki, Y. Akinaga, K. Sakakura, H. Watanabe, K. Kato, N. Watanabe, et al., J. Comput. Chem. Jpn., 18, 129 (2019). doi:10.2477/jccj.2019-0016
• [18]   Y. Mochizuki, K. Sakakura, H. Watanabe, K. Okuwaki, K. Kato, N. Watanabe, et al., J. Comput. Chem. Jpn., 19, 142 (2020). doi:10.2477/jccj.2021-0015
• [19]   Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Sato, K. Sakakura, H. Watanabe, K. Okuwaki, et al., J. Comput. Chem. Jpn., 20, 132 (2021). doi:10.2477/jccj.2022-0001
• [20]   Y. Mochizuki, T. Nakano, K. Sakakura, H. Watanabe, S. Sato, K. Okuwaki, et al., J. Comput. Chem. Jpn., 21, 106 (2022). doi:10.2477/jccj.2022-0037
• [21]   Y. Mochizuki, T. Nakano, K. Sakakura, K. Okuwaki, H. Doi, T. Kato, et al., J. Comput. Chem. Jpn., 23, 4 (2024). doi:10.2477/jccj.2024-0001
• [22]   <http://www.cenav.org/abinit-mp-open_ver-2-rev-8/>.
• [23]   A. Szabo, N. S. Ostlund, "Modern Quantum Chemistry", (1982), Macmillan.
• [24]   Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Koikegami, S. Tanimori, Y. Abe, U. Nagashima, et al., Theor. Chem. Acc., 112, 442 (2004). doi:10.1007/s00214-004-0602-3
• [25]   Y. Mochizuki, S. Koikegami, T. Nakano, S. Amari, K. Kitaura, Chem. Phys. Lett., 396, 473 (2004). doi:10.1016/j.cplett.2004.08.082
• [26]   Y. Mochizuki, K. Yamashita, T. Murase, T. Nakano, K. Fukuzawa, K. Takematsu, et al., Chem. Phys. Lett., 457, 396 (2008). doi:10.1016/j.cplett.2008.03.090
• [27]   C. E. Dykstra, E. R. Davidson, Int. J. Quantum Chem., 78, 226 (2000). doi:10.1002/(SICI)1097-461X(2000)78:4<226::AID-QUA4>3.0.CO;2-N
• [28]   T. B. Pedersen, F. Aquilante, R. Lindh, Theor. Chem. Acc., 124, 1 (2009). doi:10.1007/s00214-009-0608-y
• [29]   Y. Okiyama, T. Nakano, K. Yamashita, Y. Mochizuki, N. Taguchi, S. Tanaka, Chem. Phys. Lett., 490, 84 (2010). doi:10.1016/j.cplett.2010.03.001
• [30]   R. Hatada, K. Okuwaki, K. Akisawa, Y. Mochizuki, Y. Handa, K. Fukuzawa, et al., Appl. Phys. Express, 14, 027003 (2021). doi:10.35848/1882-0786/abdac6
• [31]   S. Tanaka, S. Tokutomi, R. Hatada, K. Okuwaki, K. Akisawa, K. Fukuzawa, et al., J. Phys. Chem. B, 125, 6501 (2021). doi:10.1021/acs.jpcb.1c03043 PMID:34124906
• [32]   K. Akisawa, R. Hatada, K. Okuwaki, Y. Mochizuki, K. Fukuzawa, Y. Komeiji, et al., RSC Adv., 11, 3272 (2021). doi:10.1039/D0RA09555A PMID:35424290
• [33]   K. Akisawa, R. Hatada, K. Okuwaki, S. Kitahara, Y. Tachino, Y. Mochizuki, et al., Jpn. J. Appl. Phys., 60, 090901 (2021). doi:10.35848/1347-4065/ac1857
• [34]   K. Okuwaki, K. Akisawa, R. Hatada, Y. Mochizuki, K. Fukuzawa, Y. Komeiji, et al., Appl. Phys. Express, 15, 017001 (2022). doi:10.35848/1882-0786/ac4300
• [35]   P. C. Hariharan, J. A. Pople, Theor. Chim. Acta, 28, 213 (1973). doi:10.1007/BF00533485
• [36]   T. H. Dunning, Jr., J. Chem. Phys., 90, 1007 (1989). doi:10.1063/1.456153
• [37]   I. Shavitt, R. J. Bartlett RJ, "Many-body methods in chemistry and physics", (2009) Cambridge Univeristy Press.
• [38]   Y. Mochizuki, K. Yamashita, K. Fukuzawa, K. Takematsu, H. Watanabe, N. Taguchi, et al., Chem. Phys. Lett., 493, 346 (2010). doi:10.1016/j.cplett.2010.05.034
• [39]   S. Obara, A. Saika, J. Chem. Phys., 84, 3963 (1986). doi:10.1063/1.450106
• [40]   S. Tanaka, C. Watanabe, T. Honma, K. Fukuzawa, K. Ohishi, T. Maruyama, J. Mol. Graph. Model., 100, 107650 (2020). doi:10.1016/j.jmgm.2020.107650 PMID:32707520
• [41]   M. Pitoňák, P. Neogrády, J. Černý, S. Grimme, P. Hobza, ChemPhysChem, 10, 282 (2009). doi:10.1002/cphc.200800718 PMID:19115327
• [42]   K. Raghavachari, G. W. Trucks, J. A. Pople, M. Head-Gordon, Chem. Phys. Lett., 157, 479 (1989). doi:10.1016/S0009-2614(89)87395-6
• [43]   Y. Mochizuki, K. Yamashita, T. Nakano, Y. Okiyama, K. Fukuzawa, N. Taguchi, et al., Theor. Chem. Acc., 130, 515 (2011). doi:10.1007/s00214-011-1036-3
• [44]   T. Ishikawa, K. Sakakura, Y. Mochizuki, J. Comput. Chem., 39, 1970 (2018). doi:10.1002/jcc.25368 PMID:30277590
• [45]   D. G. Fedorov, K. Kitaura, J. Comput. Chem., 28, 222 (2007). doi:10.1002/jcc.20496 PMID:17109433
• [46]   S. Amari, M. Aizawa, J. Zhang, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, Y. Iwasawa, et al., J. Chem. Inf. Model., 46, 221 (2006). doi:10.1021/ci050262q PMID:16426058
• [47]   K. Kitaura, K. Morokuma, Int. J. Quantum Chem., 10, 325 (1976). doi:10.1002/qua.560100211
• [48]   T. Tsukamoto, K. Kato, A. Kato, T. Nakano, Y. Mochizuki, K. Fukuzawa, J. Comput. Chem. Jpn., 14, 1 (2015). doi:10.2477/jccj.2014-0039
• [49]   Y. Okiyama, T. Nakano, C. Watanabe, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, S. Tanaka, J. Phys. Chem. B, 122, 4457 (2018). doi:10.1021/acs.jpcb.8b01172 PMID:29558137
• [50]   Y. Okiyama, C. Watanabe, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Tanaka, J. Phys. Chem. B, 123, 957 (2019). doi:10.1021/acs.jpcb.8b09326 PMID:30532968
• [51]   R. Hatada, K. Okuwaki, Y. Mochizuki, Y. Handa, K. Fukuzawa, Y. Komeiji, et al., J. Chem. Inf. Model., 60, 3593 (2020). doi:10.1021/acs.jcim.0c00283 PMID:32539372
• [52]   T. Sato, H. Nakai, J. Chem. Phys., 131, 224104 (2009). doi:10.1063/1.3269802 PMID:20001021
• [53]   <https://sourceforge.net/projects/smash-qc/>.
• [54]   S. Matsuoka, K. Sakakura, Y. Akinaga, K. Akisawa, K. Okuwaki, H. Doi, et al., J. Comput. Chem., 45, 898 (2024). doi:10.1002/jcc.27297 PMID:38158621
• [55]   K. Takaba, C. Watanabe, A. Tokuhisa, Y. Akinaga, B. Ma, R. Kanada, et al., J. Comput. Chem., 43, 1362 (2022). doi:10.1002/jcc.26940 PMID:35678372
• [56]   S. Tanaka, C. Watanabe, Y. Okiyama, Chem. Phys. Lett., 556, 272 (2013). doi:10.1016/j.cplett.2012.11.085
• [57]   Y. Okiyama, H. Watanabe, K. Fukuzawa, T. Nakano, Y. Mochizuki, T. Ishikawa, et al., Chem. Phys. Lett., 449, 329 (2007). doi:10.1016/j.cplett.2007.10.066
• [58]   Y. Okiyama, H. Watanabe, K. Fukuzawa, T. Nakano, Y. Mochizuki, T. Ishikawa, et al., Chem. Phys. Lett., 467, 417 (2009). doi:10.1016/j.cplett.2008.11.044
• [59]   D. G. Fedorov, T. Ishida, K. Kitaura, J. Phys. Chem. A, 109, 2638 (2005). doi:10.1021/jp047186z PMID:16833570
• [60]   D. G. Fedorov, K. Kitaura, J. Chem. Phys., 122, 054108 (2005). doi:10.1063/1.1835954
• [61]   J. B. Foresman, M. Head-Gordon, J. A. Pople, M. J. Frisch, J. Phys. Chem., 96, 135 (1992). doi:10.1021/j100180a030
• [62]   Y. Mochizuki, S. Koikegami, S. Amari, K. Segawa, K. Kitaura, T. Nakano, Chem. Phys. Lett., 406, 283 (2005). doi:10.1016/j.cplett.2005.03.008
• [63]   M. Head-Gordon, R. J. Rico, M. Oumi, T. J. Lee, Chem. Phys. Lett., 219, 21 (1994). doi:10.1016/0009-2614(94)00070-0
• [64]   Y. Mochizuki, K. Tanaka, K. Yamashita, T. Ishikawa, T. Nakano, S. Amari, et al., Theor. Chem. Acc., 117, 541 (2007). doi:10.1007/s00214-006-0181-6
• [65]   Y. Mochizuki, K. Tanaka, Chem. Phys. Lett., 443, 389 (2007). doi:10.1016/j.cplett.2007.06.059
• [66]   Y. Mochizuki, Chem. Phys. Lett., 453, 109 (2008). doi:10.1016/j.cplett.2008.01.014
• [67]   J. Linderberg, Y. Öhrn, "Propagators in Quantum Chemistry, 2nd Edition", (2004), Wiley.
• [68]   C. H. Hu, D. P. Chong, M. E. Casida, J. Electron Spectrosc. Relat. Phenom., 85, 39 (1997). doi:10.1016/S0368-2048(97)00037-6
• [69]   S. Tsuneyuki, T. Kobori, K. Akagi, K. Sodeyama, K. Terakura, H. Fukuyama, Chem. Phys. Lett., 476, 104 (2009). doi:10.1016/j.cplett.2009.05.069
• [70]   H. Kitoh-Nishioka, K. Ando, Chem. Phys. Lett., 621, 96 (2015). doi:10.1016/j.cplett.2014.12.057
• [71]   Y. Mochizuki, T. Ishikawa, K. Tanaka, H. Tokiwa, T. Nakano, S. Tanaka, Chem. Phys. Lett., 418, 418 (2006). doi:10.1016/j.cplett.2005.11.014
• [72]   <https://top500.org/>.
• [73]   <http://www.petachem.com/>.
• [74]   <https://www.brianqc.com/>.
• [75]   <https://www.q-chem.com/>.
• [76]   F. Zahariev, P. Xu, B. M. Westheimer, S. Webb, J. Galvez Vallejo, A. Tiwari, et al., J. Chem. Theory Comput., 19, 7031 (2023). doi:10.1021/acs.jctc.3c00379 PMID:37793073
• [77]   J. L. G. Vallejo, C. Snowdon, R. Stocks, F. Kazemian, F. C. Y. Yu, C. Seidl, et al., J. Chem. Phys., 59, 044112 (2023). doi:10.1063/5.0156399
• [78]   <https://dl.acm.org/doi/abs/10.5555/3571885.3571894>.
• [79]   K. Yasuda, J. Comput. Chem., 29, 334 (2008). doi:10.1002/jcc.20779 PMID:17614340
• [80]   K. Yasuda, J. Chem. Theory Comput., 4, 1230 (2008). doi:10.1021/ct8001046 PMID:26631699
• [81]   H. Umeda, T. Hanawa, M. Shoji, T. Boku, Y. Shigeta, J. Comput. Chem. Jpn., 13, 323 (2015). doi:10.2477/jccj.2014-0053
• [82]   T. Yoshikawa, H. Nakai, J. Comput. Chem., 36, 164 (2015). doi:10.1002/jcc.23782 PMID:25392975
• [83]   H. Umeda, T. Hanawa, M. Shoji, T. Boku, Y. Shigeta, J. Comput. Chem. Jpn., 14, 69 (2015). doi:10.2477/jccj.2015-0041
• [84]   M. Katouda, A. Naruse, Y. Hirano, T. Nakajima, J. Comput. Chem., 37, 2623 (2016). doi:10.1002/jcc.24491 PMID:27634573
• [85]   <https://www.openacc.org/>.
• [86]   S. Sakakura, Y. Mochizuki, T. Nakano, A. Naruse, S. Ohshima, T. Hoshino, et al., JSCES Conf. 29, E-13-02 (2024); the corresponding abstract will be opened in December 2024.
• [87]   J. A. Pople, R. K. Nesbet, J. Chem. Phys., 22, 571 (1954). doi:10.1063/1.1740120
• [88]Y. Kato, T. Fujiwara, Y. Komeiji, T. Nakano, H. Mori. Y. Okiyama et al., ChemBio Inf. J. 14 (2014) 1. https://www.jstage.jst.go.jp/article/cbij/14/0/14_1/_article/-char/ja/
• [89]   J. S. Binkley, J. A. Pople, Int. J. Quantum Chem., 9, 229 (1975). doi:10.1002/qua.560090204
• [90]   C. C. J. Roothaan, Rev. Mod. Phys., 32, 179 (1960). doi:10.1103/RevModPhys.32.179
• [91]   T. Tsuchimochi, G. E. Scuseria, J. Chem. Phys., 133, 141102 (2010). doi:10.1063/1.3503173 PMID:20949979
• [92]   K. R. Glaesemann, M. W. Schmidt, J. Phys. Chem. A, 114, 8772 (2010). doi:10.1021/jp101758y PMID:20443582
• [93]   P. J. Knowles, J. S. Andrews, R. D. Amos, N. C. Handy, J. A. Pople, Chem. Phys. Lett., 186, 130 (1991). doi:10.1016/S0009-2614(91)85118-G
• [94]   B. O. Roos, Intern J. Quant. Chem. Symp., 14, 175 (1980).
• [95]   B. O. Roos, P. R. Taylor, P. E. M. Sigbahn, Chem. Phys., 48, 157 (1980). doi:10.1016/0301-0104(80)80045-0
• [96]   K. Tanaka, Y. Mochizuki, T. Ishikawa, H. Terashima, H. Tokiwa, Theor. Chem. Acc., 117, 397 (2007). doi:10.1007/s00214-006-0171-8
• [97]   K. Andersson, P. A. Malmqvist, B. O. Roos, A. J. Sadlej, K. Wolinski, J. Phys. Chem., 94, 5483 (1990). doi:10.1021/j100377a012
• [98]   C. Angeli, R. Cimiraglia, S. Evangelisti, T. Leininger, J. P. Malrieu, J. Chem. Phys., 114, 10252 (2001). doi:10.1063/1.1361246
• [99]   C. Kollmar, K. Sivalingam, Y. Guo, F. Neese, J. Chem. Phys., 155, 234104 (2021). doi:10.1063/5.0072129 PMID:34937355
• [100]   T. Nakano, Y. Mochizuki, K. Yamashita, C. Watanabe, K. Fukuzawa, K. Segawa, et al., Chem. Phys. Lett., 523, 128 (2012). doi:10.1016/j.cplett.2011.12.004
• [101]   C. Watanabe, K. Fukuzawa, Y. Okiyama, T. Tsukamoto, A. Kato, S. Tanaka, et al., J. Mol. Graph. Model., 41, 31 (2013). doi:10.1016/j.jmgm.2013.01.006 PMID:23467020
• [102]   Y. Okiyama, T. Tsukamoto, C. Watanabe, K. Fukuzawa, S. Tanaka, Y. Mochizuki, Chem. Phys. Lett., 566, 25 (2013). doi:10.1016/j.cplett.2013.02.020
• [103]   K. Kato, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, Chem. Phys. Lett., 629, 58 (2015). doi:10.1016/j.cplett.2015.03.057
• [104]   Y. Okiyama, T. Nakano, C. Watanabe, K. Fukuzawa, Y. Komeiji, K. Segawa, et al., Bull. Chem. Soc. Jpn., 94, 91 (2021). doi:10.1246/bcsj.20200227
• [105]   T. Nakano, Y. Komeiji, Y. Okiyama, Y. Mochizuki, J. Comput. Chem. Jpn., -Int. Ed., (accepted) https://www.jstage.jst.go.jp/article/jccjie/10/0/10_2023-0038/_article/-char/en
• [106]   Y. Sakai, E. Miyoshi, H. Tatewaki, J. Mol. Struct. THEOCHEM, 451, 143 (1998). doi:10.1016/S0166-1280(98)00167-5
• [107]   T. Ishikawa, Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Amari, H. Mori, H. Honda, et al., Chem. Phys. Lett., 427, 159 (2006). doi:10.1016/j.cplett.2006.06.103
• [108]   S. Tsushima, J. Kretzschmar, H. Doi, K. Okuwaki, M. Kaneko, Y. Mochizuki, et al., Chem. Commun. (Camb.), 60, 4769 (2024). doi:10.1039/D4CC01030B
• [109]   P. J. Hay, W. R. Wadt, J. Chem. Phys., 82, 270 (1985). doi:10.1063/1.448799
• [110]   W. R. Watt, P. J. Hay, J. Chem. Phys., 82, 284 (1985). doi:10.1063/1.448800
• [111]   P. J. Hay, W. R. Wadt, J. Chem. Phys., 82, 299 (1985). doi:10.1063/1.448975
• [112]   K. Kitaura, S. I. Sugiki, T. Nakano, Y. Komeiji, M. Uebayasi, Chem. Phys. Lett., 336, 163 (2001). doi:10.1016/S0009-2614(01)00099-9
• [113]   Y. Komeiji, T. Nakano, K. Fukuzawa, Y. Ueno, Y. Inadomi, T. Nemoto, et al., Chem. Phys. Lett., 372, 342 (2003). doi:10.1016/S0009-2614(03)00430-5
• [114]   Y. Komeiji, M. Uebayasi, R. Takata, A. Shimizu, K. Itsukashi, M. Taiji, J. Comput. Chem., 18, 1546 (1997).
• [115]   Y. Komeiji, Y. Mochizuki, T. Nakano, D. G. Fedorov, J. Mol. Struct. THEOCHEM, 898, 2 (2009). doi:10.1016/j.theochem.2008.07.001
• [116]   Y. Komeiji, Y. Mochizuki, T. Nakano, Chem. Phys. Lett., 484, 380 (2010). doi:10.1016/j.cplett.2009.11.045
• [117]   Y. Mochizuki, T. Nakano, Y. Komeiji, K. Yamashita, Y. Okiyama, H. Yoshikawa, et al., Chem. Phys. Lett., 504, 95 (2011). doi:10.1016/j.cplett.2011.01.039
• [118]   D. G. Fedorov, Y. Alexeev, K. Kitaura, J. Phys. Chem. Lett., 2, 282 (2011). doi:10.1021/jz1016894
• [119]   T. Nagata, D. G. Fedorov, K. Kitaura, Chem. Phys. Lett., 492, 302 (2010). doi:10.1016/j.cplett.2010.04.043
• [120]   T. Tsukamoto, Y. Mochizuki, N. Watanabe, K. Fukuzawa, T. Nakano, Chem. Phys. Lett., 535, 157 (2012). doi:10.1016/j.cplett.2012.03.046
• [121]   K. Okuwaki, N. Watanabe, K. Kato, C. Watanabe, N. Nakayama, A. Kato, et al., J. Chem. Inf. Model., (2024)., accepted, https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.4c01280
• [122]   M. Manathunga, A. W. Götz, K. M. Merz, Jr., Curr. Opin. Struct. Biol., 75, 102417 (2022). doi:10.1016/j.sbi.2022.102417 PMID:35779437
• [123]   R. D. Groot, P. B. Warren, J. Chem. Phys., 107, 4423 (1997). doi:10.1063/1.474784
• [124]   C. F. Fan, B. D. Olafson, M. Blanco, S. L. Hsu, Macromolecules, 25, 3667 (1992). doi:10.1021/ma00040a010
• [125]   K. Okuwaki, Y. Mochizuki, H. Doi, T. Ozawa, J. Phys. Chem. B, 122, 338 (2018). doi:10.1021/acs.jpcb.7b08461 PMID:29285920
• [126]   K. Okuwaki, H. Doi, Y. Mochizuki, J. Comput. Chem. Jpn., 17, 102 (2018). doi:10.2477/jccj.2017-0048
• [127]   H. Doi, S. Matsuoka, K. Okuwaki, R. Hatada, S. Minami, R. Suhara, et al., Jpn. J. Appl. Phys., 62, 070901 (2023). doi:10.35848/1347-4065/ace575
• [128]   K. Okuwaki, H. Doi, T. Ozawa, Y. Mochizuki, Jpn. J. Appl. Phys., 62, 110902 (2023). doi:10.35848/1347-4065/ad0601
• [129]   A. Aspuru-Guzik, A. D. Dutoi, P. J. Love, M. Head-Gordon, Science, 309, 1704 (2005). doi:10.1126/science.1113479 PMID:16151006
• [130]   Y. Cao, J. Romero, J. P. Olson, M. Degroote, P. D. Johnson, M. Kieferová, et al., Chem. Rev., 119, 10856 (2019). doi:10.1021/acs.chemrev.8b00803 PMID:31469277
• [131]   B. Bauer, S. Bravyi, M. Motta, G. K.-L. Chan, Chem. Rev., 120, 12685 (2020). doi:10.1021/acs.chemrev.9b00829 PMID:33090772
• [132]   S. McArdle, S. Endo, A. Aspuru-Guzik, S. C. Benjamin, X. Yuan, Rev. Mod. Phys., 92, 015003 (2020). doi:10.1103/RevModPhys.92.015003
• [133]   M. Reiher, N. Wiebe, K. M. Svore, D. Wecker, M. Troyer, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 114, 7555 (2017). doi:10.1073/pnas.1619152114 PMID:28674011
• [134]   Z. Li, J. Li, N. S. Dattani, C. J. Umrigar, G. K. L. Chan, J. Chem. Phys., 150, 024302 (2019). doi:10.1063/1.5063376 PMID:30646701
• [135]S. Lee, J. Lee, H. Zhai, Y. Tong, A. M. Dalzell, A. Kumar et al., Nature Comm. 14 (2023) Article No. 1952.https://www.nature.com/articles/s41467-023-37587-6
• [136]   T. Yamazaki, S. Matsuura, A. Narimani, A. Saidmuradov, A. Zaribafiyan, arXiv:1806.01305 (2018).https://arxiv.org/abs/1806.01305
• [137]   V. Senicourt, J. Brown, A. Fleury, R. Day, E. Lloyd, M. P. Coons, et al., arXiv:2206.1242 (2022).https://arxiv.org/abs/2206.12424
• [138]   H. Lim, D. H. Kang, J. Kim, A. Pellow-Jarman, S. McFarthing, R. Pellow-Jarman, et al., Sci. Rep., 14, 2422 (2024). doi:10.1038/s41598-024-52926-3 PMID:38287087
• [139]   J. Romero, R. Babbush, J. R. McClean, C. Hempel, P. J. Love, A. Aspuru-Guzik, Quantum Sci. Technol., 4, 014008 (2018). doi:10.1088/2058-9565/aad3e4
• [140]   K. Sugisaki, T. Kato, Y. Minato, K. Okuwaki, Y. Mochizuki, Phys. Chem. Chem. Phys., 24, 8439 (2022). doi:10.1039/D1CP04318H PMID:35343527
• [141]   K. Sugisaki, V. S. Prasannaa, S. Ohshima, T. Katagiri, Y. Mochizuki, B. K. Sahoo, et al., Electron. Struct., 5, 035006 (2023). doi:10.1088/2516-1075/acf909
• [142]   K. Sugisaki, T. Nakano, Y. Mochizuki, J. Comput. Chem., 45, 2204 (2024). doi:10.1002/jcc.27438 PMID:38795375
• [143]   H. Bayraktar, A. Charara, D. Clark, S. Cohen, T. Costa, Y.-L. L. Fang, et al., arXiv:2308.01999 (2023).https://arxiv.org/abs/2308.01999
• [144]   R. Babbush, J. McClean, D. Wecker, A. Aspuru-Guzik, N. Wiebe, Phys. Rev. A, 91, 022311 (2015). doi:10.1103/PhysRevA.91.022311
• [145]   K. Sugisaki, arXiv:2406.09830 (2024). AIP Advances 14, 095021 (2024). https://pubs.aip.org/aip/adv/article/14/9/095021/3312642/Does-the-full-configuration-interaction-method
• [146]C. Watanabe, H. Watanabe, Y. Okiyama. D. Takaya, K. Fukuzawa, S. Tanaka et al., Chem-Bio Inf. J. 19 (2018) 5.https://www.jstage.jst.go.jp/article/cbij/19/0/19_5/_article
• [147]   D. Takaya, C. Watanabe, S. Nagase, K. Kamisaka, Y. Okiyama, H. Moriwaki, et al., J. Chem. Inf. Model., 61, 777 (2021). doi:10.1021/acs.jcim.0c01062 PMID:33511845
• [148]   K. Fukuzawa, K. Kato, C. Watanabe, Y. Kawashima, Y. Handa, A. Yamamoto, et al., J. Chem. Inf. Model., 61, 4594 (2021). doi:10.1021/acs.jcim.1c00694 PMID:34506132
• [149]   <https://fmodd.jp/>.
• [150]Y. Hayashi, J. Shiomi, J. Morikawa, R. Yoshida, npj Comp. Mater. 8 (2022) Art. No. 222.https://www.nature.com/articles/s41524-022-00906-4