日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集
第46回日本植物生理学会年会講演要旨集
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シロイヌナズナゲノム統合データベースRARGEの機能拡張
*秋山 顕治櫻井 哲也佐藤 将一飯田 慶関 原明黒森 崇伊藤 卓也小長谷 明彦豊田 哲郎篠崎 一雄
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p. 485

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抄録
RIKEN Arabidopsis Genome Encyclopedia (RARGE)ゲノム統合データベースでは、完全長cDNA、プロモーター、挿入変異体、マイクロアレイ実験データを含む、シロイヌナズナの基礎的なリソース情報を提供している。また、これらのデータに対しキーワード、相同性、リソースコードをキーに用いた検索機能を実装している。我々はこれまでに245,946個のcDNA、11,933ラインの挿入変異体を収集し、これらにまつわるデータをデータベース化して公開している。今回、新たに1,764 TUの選択的スプライシングに関する情報の提供を開始した。スプライシングの種別ごとに転写産物の情報がまとめられ、アラインメント、ゲノムマッピング情報と併せて閲覧することができる。さらに、利用者の統合的な解析を支援する検索サービスの機能拡張についても述べる。
RARGE (http://rarge.gsc.riken.jp/)
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© 2005 日本植物生理学会
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