化学と生物
Online ISSN : 1883-6852
Print ISSN : 0453-073X
解説
次世代シークエンスデータベースの活用法最前線
仲里 猛留坊農 秀雅
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54 巻 (2016) 12 号 p. 873-877

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抄録

次世代シークエンサー(NGS: next generation sequencer)の活躍によって,さまざまな生命科学の謎が解き明かされている.マイクロアレイ同様,NGSから得られるデータも公共データベースに収めることが論文投稿の条件となってきており,そのデータ量は約3.2ペタバイトにもなっている(ペタは10の15乗).これまでよく用いられてきたBLASTなどの配列類似性による検索手段ではもはや歯がたたず,それぞれのデータの付帯情報であるメタデータをたよりに必要な情報を探し出すことになる.膨大なNGSのデータベースから効率よくデータを取り出し,自らの研究に活用する方策を紹介する.

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© 2016 by Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
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