解説
次世代シークエンスデータベースの活用法最前線
2016 年 54 巻 12 号 p. 873-877
詳細
2016 年 54 巻 12 号 p. 873-877
次世代シークエンサー（NGS: next generation sequencer）の活躍によって，さまざまな生命科学の謎が解き明かされている．マイクロアレイ同様，NGSから得られるデータも公共データベースに収めることが論文投稿の条件となってきており，そのデータ量は約3.2ペタバイトにもなっている（ペタは10の15乗）．これまでよく用いられてきたBLASTなどの配列類似性による検索手段ではもはや歯がたたず，それぞれのデータの付帯情報であるメタデータをたよりに必要な情報を探し出すことになる．膨大なNGSのデータベースから効率よくデータを取り出し，自らの研究に活用する方策を紹介する．
