短報
16S rRNA遺伝子およびgyrB遺伝子に基づくRubritalea属細菌の系統解析
2010 年 26 巻 2 号 p. 89-95
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2010 年 26 巻 2 号 p. 89-95
様々な環境中に生息するRubritalea属細菌は，16S rRNA遺伝子塩基配列では区別できない多数の種を含んでいる．本研究では，これまでに知られているRubritalea属の菌種および今回新たに分離した6株についてgyrB遺伝子による系統解析を行った．その結果，16S rRNA遺伝子塩基配列より，gyrB遺伝子塩基配列の方が系統解析上高い解像度を示した．さらに，ゲノムDNA交雑実験や生化学実験の結果もgyrB遺伝子塩基配列に基づく系統解析の結果を支持した．本研究の結果からgyrB遺伝子は ‘Verrucomicrobia’ 門に属するRubritalea属の系統解析に適していることが明らかになった．
