アポトーシスに関するシグナル伝達オントロジーに基づくシミュレーション構築

抄録

生物学的分野における有効な知識利用には計算機によるシミュレーションが不可欠である．本研究ではアポトーシスに関する知識をオントロジーにより整備し，オントロジーの定性的知識に基づくシミュレーション構築を行う．オントロジーベースのシミュレーションには実時間によらない定性的な時間概念の表現が必須である．そこで，時区間概念と因果関係による時間長さと時間前後関係の把握からのシミュレーションについて考察する．