分子シミュレーションによる分子内運動の計測

抄録

分子内運動を計算機シミュレーションで計測するのに有効な手法について述べる。そのた めに、我々は拡張アンサンブル法というシミュレーション法の適用を提唱してきた。この 手法は、人工の統計力学的アンサンブルに基づいて、自然界では起こり得ないような大き な構造揺らぎを引き起こすことにより、分子内運動の時間発展を大幅に加速する。更に、 この手法は一回のシミュレーションから、任意の温度の情報を取り出すことができる。