糖鎖構造解析を支援するためのウェブアプリケーション

抄録

アスパラギン残基に結合している糖鎖 (N型糖鎖) の構造解析法として“2-D/3-D糖鎖マッピング法”を私達が提唱 (Anal. Biochem., 1988年, 1995年) して以来、約500種に及ぶ糖鎖構造がこの方法により明らかになりました。この蓄積されたデータを基にして2-D/3-D糖鎖マッピング法をより効果的に利用するために私達はウェブアプリケーション“GALAXY”(Glycoanalysis by the three axes of MS and chromatography) を開発しました。
このアプリケーションは、2-D/3-D糖鎖マッピング法あるいは質量分析によって得られたデータにあてはまる構造の候補を蓄積されたデータから探し出すのを容易にします。また推定したPA糖鎖のマップ上の座標値を予想したり、PA糖鎖にグリコシダーゼ処理を施した場合におけるマップ上の座標値の移動をグラフィカルに追跡することも可能です。