過去数十年間分子情報による系統解析が進み，陸上植物の分類システムは大きく変わった．最新情報をもとに，新しい陸上植物の分類システムと，そこから生まれる新たな課題について紹介した．主な点は，⑴陸上植物はゼニゴケ植物門（タイ類），マゴケ植物門（蘚類），ツノゴケ植物門，ヒカゲノカズラ植物門（小葉類），シダ植物門，裸子植物門，被子植物門という７つの群（植物門）からなること，⑵ツノゴケ植物門が維管束植物の姉妹群であること，⑶マツバラン類とトクサ類はシダ類と単系統群（シダ植物門）であること，⑷現生裸子植物（グネツム類も含む）は単系統群（裸子植物門）であること，などである．また，最も大きな被子植物門は原始被子植物群（側系統群），単子葉植物，真正双子葉植物の３群に分けられ，原始被子植物群のアンボレラ目（Amborella trichopoda１種のみ）が残り全ての被子植物の姉妹群である．更に，被子植物では科の分解，統合，配置換えが進んだ結果，科は446科（うち単子葉植物は81科）を数えるまでに増えた．しかし，10種以下からなる小さな科が全体の33％（148科）を占め，そこに残されている進化の証拠を知るための形態観察（生活史も含む）の研究が遅れている．