高精度シグナルペプチド予測システム：SOSUIsignal

抄録

シグナルペプチドの３つのドメイン構造のアミノ酸配列に見られる物理化学的特徴に着目し、高精度なシグナルペプチド予測システムを開発した。予測システムは、疎水性の高いセグメントの検出、シグナルアンカーを含むシグナル配列の予測、シグナルアンカーとシグナルペプチドの判別という３つのモデュールからなる。このシステムでは高精度な予測のために、疎水性指標に加え、ＳＳ指標、ＳＰ指標を新たに考案した。真核生物のシグナルペプチド配列を、従来の方法より高精度で判別することができた（Matthewsの相関係数が0.89）。また、SOSUIsignalで最適化するパラメータはわずか５個であるため、極めて高速な予測が可能である。