ASEDock － 結合部位の形状に基づく高速ドッキング

抄録

受容体表面の窪みをアルファサイトとして検出し、その形状と受容体原子による排除体積に基づいてリガンドの占めるべき位置と入れない位置を表わすASE モデルを考案した。それに対してリガンドを剛体で重ね合わせることにより、高速かつ高効率にリガンドを受容体上に配置するドッキング法、 ASEDock を開発した。これを高解像度の受容体‐リガンド複合体構造のテストセットで検証した結果を報告する。