論文種目：総合論文
二本鎖RNA結合タンパク質が結合するマイクロRNA初期転写産物の構造的特徴の解析
2021 年 65 巻 1 号 p. 13-16
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2021 年 65 巻 1 号 p. 13-16
二本鎖RNA結合タンパク質であるNuclear Factor 90（NF90）は結合パートナーであるNF45と複合体を形成し，機能性小分子RNAであるマイクロRNA（miRNA）の初期転写産物（pri-miRNA）に結合することで当該miRNAの生合成を抑制する．一方，NF90が結合するpri-miRNAの構造的特徴は不明であった．我々は，ENCODEに登録されたeCLIP-seqの結果からNF90が結合しプロセッシングを抑制する候補pri-miRNAを探索し，当該pri-miRNAに「自由エネルギーが低くミスマッチの少ない安定なステム構造を有する」という特徴を見出した．この結果をもとにRNA-EMSAを実施し，pri-miRNAのステム構造にミスマッチ変異を導入することで，NF90の結合性が低下することを実証した．本研究から，NF90が結合するpri-miRNAの構造的特徴が明らかとなった．
