抄録
インシリコ創薬は，従来の実験を主体とした手法に理論・計算化学に基づく分子科学計算を応用した創薬手法である．近年の飛躍的なコンピュータの演算能力の向上も相俟って，従来の試行錯誤的なアプローチをより効率化・迅速化させることが期待されている．例えば，インシリコ技術を活用してタンパク質に対する薬物（リガンド）の結合親和性を評価する場合，ドッキングや古典的な結合自由エネルギー評価法（molecular mechanics／Poisson-Boltzmann surface area：MM／PBSA）などのポストドッキング解析は，実用的かつ簡便な手法であると考えられる．一方，その精度についてはどうであろう．本稿では，ドッキングやMM／PBSAの解析において，リガンドとタンパク質の結合を媒介する水分子（架橋水）や電子分極効果の重要性ならびに，これらが予測精度に与える影響を議論・検討したLiuらの報告を紹介する．
なお，本稿は下記の文献に基づいて，その研究成果を紹介するものである.
1) Liu J. et al., J. Chem. Inf. Model., 53, 1306-1314 (2013).
