FYI（用語解説）
ショットガンシーケンス
2017 年 53 巻 11 号 p. 1101_2
詳細
2017 年 53 巻 11 号 p. 1101_2
腸内細菌メタゲノム解析では，細菌の全ゲノム情報を解析し，どのような菌がどれくらい存在するかという情報以外に，どのような遺伝子をどれくらい持つかなども知ることができる．糞便などから抽出した全ゲノムDNAを，制限酵素などで物理的に切断し，切断された短いDNA鎖を，次世代シーケンサーを用いて無作為に配列の決定をする．そのDNA断片の配列の重なり部分をコンピュータ上でつなぎ合わせることで，連続した全ゲノムの遺伝子配列を決定するという方法である．ヒトゲノム計画でも，この方法を用いて解析された．コンピュータの計算処理能力の進歩とデータ処理方法の開発により，遺伝子配列が比較的容易に決定できるようになった．
