抄録
SSRマーカー（別名マイクロサテライト）は，共優性で情報量が多いことから，集団の多様性解析，個体の識別，遺伝子流動，遺伝子地図作成において，現在最も有効なDNAマーカーである。その特徴は，共優性の遺伝様式を示すこと，多型性が高く近縁の個体間でも差異が得やすいこと，反復数が変異に富んでおり対立遺伝子数が多いこと，ゲノム中に豊富に存在すること，微量のサンプルで分析が可能であること，DNAシークエンサーなど自動分析に適していることが挙げられる。クリ品種「筑波」のゲノミックDNAを用いて，(AG) / (CT)の反復配列をターゲットとして，マグネットビーズによる濃縮法によりSSRマーカーを作成した。開発した15種類のSSRは，1～16の対立遺伝子を持ち，ヘテロ接合度の観察値HOが平均で0.47，ヘテロ接合度の期待値HEが平均で0.50，識別能力（power of discrimination）が平均で0.62と多型性が高く，クリの個体識別に有効であった。多型を示した14種類のSSR座について，クリ30品種・系統を分析した結果，すべての品種・系統が識別可能であった。4つのクリのタイプ（日本由来栽培，韓国由来栽培，日本由来自生，韓国由来自生）で対立遺伝子の種類やその頻度分布を見たところ，明確な遺伝的多様性の差異はなかった。また，クリで開発したSSRマーカーは，他種にも適用可能であり，多型頻度も高かった。
