ポリエージェントロジスティクスは流動的で多品種少量化するマーケットに迅速柔軟に対応するとともに、災害などにおいても供給連鎖と配送を極力途絶させないことを目的としポリエージェントに基盤をおくロジスティクスである。ポリエージェントロジスティクスでは船舶、列車、車両、コンテナ、通い箱や倉庫などをポリエージェントとし、調達管理と販売管理や入出庫管理や在庫の引き当てや入出荷予定の管理並びに配送の手配を行う仮想的な物流センターとして扱う。ポリエージェントメッセンジャーは既存のサイトを必要とせずに自律分散協調による需給のマッチングや取引を行い、仮想的な物流センターの調達管理と販売管理や配送手配を実現させる。