近年、翻訳後修飾を保持した状態でアミノ酸主鎖の解離が可能である電子転移解離(Electron Transfer Dissociation ; ETD)を用いたプロテオミクス解析例が多く示されております。しかし、現在のところイオントラップタイプの質量分析計でのみ、ETDによる解析が可能となっております。 高分解能、高精度なQTOF型質量分析計とETDによる断片化法を組み合わせることにより、データクオリティーの大幅な向上および、より大きなペプチド・たんぱく質解析への応用も期待されます。 ここでは、ETD-QTOF型質量分析装置によるユビキチンのETDフラグメント解析に加え、ETD-LC-MS/MSを用いたBSAトリプシン消化物分析におけるの自動化・高速サンプリングデータをお示し致します。