抄録
細菌（原核生物）の分類学は，1980年代中頃から用いられるようになった16S rRNAをコードする遺伝子（16S rDNA）の塩基配列を基とした系統分類により劇的に変化した．現在の分類学によると，ヒトの口腔から大腸にいたる消化管内に生息する菌は，Archaeaの2門のうちの1門，すなわちEuryarchaeota門とBacteriaの26門のうちの8門，すなわちActinobacteria，Bacteroidetes，Fibrobacteres，Firmicutes，Fusobacteria，Proteobacteria，Spirochaetes，Tenericutesの各門に分布している．これらの消化管内に生息する菌およびその近縁の菌について，現在の分類学における位置をまとめた．
