太平洋戦争中，雑誌は経済統制と物資不足で統廃合，廃刊が続いた。「薬学雑誌」は抄録だけのものが定期発行を許され，昭和20年にはガリ版刷りとなり，戦後の発行もなかなか正常化しなかった。「科学」は，戦争が終わると原爆，原子力の時代を告げる一方，登呂遺跡や昭和新山など戦時中の発見を遅れて掲載している。そしてローマ字書きの巻頭言が現れ，国語はなるべく簡潔にしようという運動を支持する。また，戦後すぐに創刊された「医学のあゆみ」は海外雑誌の翻訳記事が主体で，紙不足に苦しみながらも，戦争中に進展したサルファ剤の研究，また新たに発見されたペニシリン，ストレプトマイシンの情報を，世界から取り残されていた我が国の読者に紹介していた。
