環境工学研究論文集 第56巻
メタバーコーディングと定量PCRから得た水生昆虫環境DNA量と水生昆虫現存量の関係
2019 年 75 巻 7 号 p. III_281-III_288
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2019 年 75 巻 7 号 p. III_281-III_288
河川水から抽出したDNA（環境DNA）をテンプレートとして無脊椎動物のcytochrome oxidase subunit 1領域の濃度を定量PCRにより定量した．さらに同一の遺伝子領域をメタバーコーディング解析し，得られた全塩基配列数のうち水生昆虫6目（カゲロウ，カワゲラ，トビケラ，ハエ，トンボ，コウチュウ）に属する塩基配列の相対存在比を，定量DNA濃度と掛け合わせ，水生昆虫由来の環境DNA濃度（copies/L）を求めた．捕獲調査により得られた水生昆虫の現存量と相関分析した結果，水生昆虫由来の環境DNA定量値は全採集個体数密度（相関係数0.74，p < 0.01），カゲロウ目，カワゲラ目，ハエ目の個体数密度と正の相関を示した．これらの分類群については回帰式を推定することができ，本手法が環境DNAを用いた水生昆虫量の定量に有効である可能性を示した．
