【目的】関節リウマチ（RA）において，へルパーT細胞，CD25制御性T細胞を含むCD4+T細胞は多様な機能を担う．我々は，CD4+T細胞亜分画の遺伝子発現解析を行い，RA患者と健常人との比較，また同一RA患者のアバタセプト（ABT）投与前後の比較解析を行った．【方法】健常人9名，RA患者12名の末梢血CD4+T細胞7亜分画（ナイーブT細胞・濾胞性ヘルパーT細胞・Th1・Th2・Th17・Th17.1・CD25制御性T細胞）をFACSで分取し，RNA-Seq解析を行った．RA患者のうち3名では，ABT投与前と投与6か月後のサンプルを解析した．【結果】外れ値を除いた142サンプルのPCA解析では，RAと健常人は明らかに分けられ，またABT投与後群はPCA1上で健常人に近い位置に集団を形成した．健常人を対照としたRAのCD4+亜分画の発現変動遺伝子（DEG）は，亜分画間の差は明確ではなかった．しかし，ABT投与前後の比較を全サブセットをまとめて行うと，著しい発現変動を認めた．WGCNAによって発現傾向が類似した遺伝子集団を分画したところ，ABT投与とDAS28-CRPと強く相関する遺伝子群が同定された．本遺伝子群の上位10遺伝子にはJAK3，ZAP70が含まれており，ABT投与はTCRシグナル下流遺伝子を強く抑制することが示唆された．【結論】RAと健常人の末梢血CD4+T細胞は明確な遺伝子発現の差を認めた．ABTによる治療は各サブセットすべてに強い遺伝子発現の変動を与え，特にTCRシグナル下流の遺伝子が著明に抑制されていた．
