抄録
近年、様々な生物種においてsiRNA（short interfering RNA）は相同性に依存し、 mRNAの分解と、ヌクレオソームのヘテロクロマチン化誘導という二つの大きく異なる機能を持つことが見いだされた。興味深いことにこれらの異なった二つの機能は、非常に類似したRNAサイレンシング分子機構に依存していると考えられている。
我々は、イネにおける内在遺伝子と外来遺伝子それぞれのプロモーター領域と転写領域、つまりユークロマチン領域をターゲットに、dsRNAをトリガーとしたサイレンシングとエピジェネティックな影響について解析を行った。
転写領域をターゲットとした場合、配列特異性に依存したサイレンシングが観察され、さらに植物や線虫に特有の現象であるトランジティブRNAサイレンシングは、外来遺伝子に対してのみ起きることが明らかとなった。ターゲット転写領域は、RNAサイレンシングに伴いde novo DNAメチル化されていた。またプロモーター領域をターゲットとした場合には、内在・外来遺伝子ともにde novo DNAメチル化が認められたが、サイレンシングは外来遺伝子のみに観察された。
以上の結果から、 siRNAは内在遺伝子に対して配列特異的なRNA分解とde novo DNAメチル化を誘導する。しかし、転写を不活性化するヘテロクロマチン化の誘導にとってsiRNAのみでは不十分である可能性が示唆された。
