抄録
光合成系や呼吸系などの電子伝達系のサブユニットタンパク質の多くが膜タンパク質である。プロテオミクス解析の進展に合わせて、MS分析技術が向上し、ゲノムが解析された生物に於いては可溶性タンパク質のタンパク質の同定が容易になった。しかし、膜タンパク質は、水溶性タンパク質に比べるとMS分析で同定できる可能性が低い。また、モデル生物以外のゲノム解析のされていない生物では、MS分析の応用可能性は低い。
このような場合、膜タンパク質の同定のためには、タンパク質を電気泳動で分離し、アミノ酸配列解析を行うことが有効な手段となる。N末端がブロックされていると、内部配列の解析が必要になるが、タンパク質を抽出し、濃縮後トリプシンなどにより限定分解することが有効である。しかし、膜タンパク質は、そのような手法の適用が困難な場合が多い。本研究では、光化学系II反応中心複合体タンパク質D1と、酸素発生系の可溶性タンパク質PsbOタンパク質を比較しつつ、膜タンパク質の分析手法の改善を行った。その過程でCoomassie Blue R250の性質を利用することが効果的であることが判明した。この手法は、ゲノム解析がなされていない多くの生物での膜タンパク質を研究対象としたプロテオミクスに道を開くものと期待される。
